NeuroClaw 是一个面向可执行、可复现神经影像研究的 Research Assistant。其核心优势在于 神经影像数据集与模型适配:将原始扫描快速转化为可用输入,并使临床与研究人员以最小配置成本运行深度学习模型。
神经影像数据集需要专业的预处理,而预处理质量直接决定模型有效性。许多流程假设数据已被严格整理,而 MedicalClaw 对开源模型执行的自动化支持有限(主要集中在 TimesFM 和 AlphaFold 等大型项目),导致用户需投入大量时间在环境配置上。
NeuroClaw 强调 数据处理 与 模型配置/执行。它既提供独立可用的 GUI 和 CLI 工具,也可以作为技能库集成到 OpenClaw、Hermes、Claude Code 等 agent 项目中。
说明
- 我们构造了 NeuroBench 用于评估 multi-agent 在神经影像工作流(特别是原始数据处理和模型执行)中的性能,并计划完善基准、评测现有 medical claw 与 general claw 系统。
- 每个 SKILL.md 的末尾标注作者信息,如有问题请向对应作者提交 issue。
- [2026.05.23]:NeuroBench 现已覆盖数据处理与模型运行。
- [2026.05.20]:
neurooracle.atoms形式化 7 原子 × 15 标准任务 + 4 条中介链 - [2026.05.15]:NeuroOracle 上线,知识图谱探索器与假设引擎,在线 demo 见 https://huggingface.co/spaces/zxcvb20001/NeuroOracle。
- [2026.05.06]:新增 19 个数据集和模态技能及配套脚本;全部 86 个技能统一元数据格式(
layer、skill_type、dependencies);skill_loader DAG 验证确保依赖图无环。 - [2026.04.28]:我们的技术报告已上线 arXiv:https://arxiv.org/abs/2604.24696
- [2026.04.22]:v1.0 发布,稳定版发布,包含改进与完整文档。
- [2026.04.17]:项目首页已上线,欢迎访问:https://cuhk-aim-group.github.io/NeuroClaw/
- [2026.04.08]:NeuroBench 发布,用于 multi-agent 神经影像工作流评估。
- [2026.04.02]:v0.1 发布,NeuroClaw 框架和核心功能完成。
- 数据集上下文规划:围绕数据集结构、元数据和工作流阶段来组织能力,而不是简单围绕“调用哪个工具”
- 自动技能推荐:用户指定目标数据集后,NeuroClaw 会推荐相关技能并生成可执行工作流
- 预处理约束感知:在编排过程中考虑特定数据集的模态可用性和预处理要求
| 数据集 | 支持模态 | 附加数据 | 队列规模 | 官方链接 |
|---|---|---|---|---|
| ABCD Study | T1w; T2w; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI | 身体与心理健康、物质使用、文化/环境、神经认知、生物学数据 | 目标队列约 11,500 名儿童;完整批次通过 NIMH Data Archive 发布 | https://abcdstudy.org/ |
| ABIDE | T1w; rs-fMRI | ASD/对照表型数据 | 来自 17 个国际站点的 1,112 份数据集 | https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ |
| ADHD-200 | T1w; rs-fMRI | 诊断状态、ADHD 症状量表、人口统计学信息、用药史、质控指标 | 8 个成像站点共 776 名参与者/数据集 | https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/adhd200/ |
| AIBL | T1w; PET (PiB, FDG, tau) | 认知评估、血液生物标志物、生活方式与人口统计学数据、APOE 基因型 | 约 1,100+ 名参与者(健康对照、MCI、AD) | https://aibl.csiro.au/ |
| AOMIC | T1w; rs-fMRI; task-fMRI | 人格特质(大五人格)、流体智力、人口统计学数据 | 约 1,000+ 名参与者 | https://nilab-uva.github.io/AOMIC.github.io/ |
| ADNI | T1w; T2w; FLAIR; dMRI; rs-fMRI; PET | 遗传/组学数据、临床与认知评估 | ADNI 各阶段累计约 2,000+ 名参与者 | https://adni.loni.usc.edu/ |
| BOLD5000 | T1w; task-fMRI | 视觉图像刺激、类别与图像元数据 | 4 名参与者,完成 5,000 张图像的视觉 fMRI 实验 | https://bold5000-dataset.github.io/ |
| Cam-CAN | T1w; T2*w; rs-fMRI; task-fMRI; MEG | 覆盖成人寿命跨度的认知、感觉与健康测量 | 约 700 名 18-88 岁参与者 | https://www.cam-can.org/ |
| COBRE | T1w; rs-fMRI | 人口统计学信息、利手信息、诊断信息 | 147 名参与者:72 名精神分裂症患者和 75 名健康对照 | https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/retro/cobre.html |
| DMT-HAR-MED | rs-fMRI | 致幻剂干预条件、行为与生理测量 | OpenNeuro ds006644 中的 40 名参与者 | https://openneuro.org/datasets/ds006644/versions/1.0.1 |
| HBN | T1w; T2w; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI; EEG | 精神病学、行为、认知、生活方式、遗传学、活动记录 | 已发布约 3,900+ 名参与者;目标资源不少于 10,000 名 5-21 岁个体 | https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_healthy_brain_network/ |
| HCP Aging | T1w; T2w; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI | 行为、认知、健康与人口统计学测量 | 约 700+ 名 36-100 岁成人 | https://www.humanconnectome.org/study/hcp-lifespan-aging |
| HCP Development | T1w; T2w; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI | 行为、认知、健康与人口统计学测量 | 约 600+ 名 5-21 岁儿童与青少年 | https://www.humanconnectome.org/study/hcp-lifespan-development |
| HCP Early Psychosis | T1w; T2w; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI | 诊断、临床、行为与认知测量 | 约 250 名早期精神病与对照参与者 | https://www.humanconnectome.org/study/hcp-early-psychosis |
| HCP Young Adult | T1w; T2w; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI | 行为与认知测量 | 约 1,200 名青年成人参与者 | https://www.humanconnectome.org/study/hcp-young-adult |
| IXI | T1w; T2w; MRA | 来自伦敦三家医院的健康脑 MRI 数据 | 约 600 名受试者 | https://brain-development.org/ixi-dataset/ |
| MS Challenge | T1w; T2w; FLAIR; PD | 专家手动病灶分割标注,用于 MS 分割基准 | 5 名 MS 患者的多时间点纵向数据 | https://smart-stats-tools.org/lesion-challenge |
| MND | rs-fMRI; task-fMRI | 运动神经元病诊断与临床测量 | OpenNeuro ds005874 中的 59 名参与者 | https://openneuro.org/datasets/ds005874/versions/1.1.0 |
| Natural Scenes Dataset | T1w; task-fMRI | 自然图像刺激、行为反应、图像标注 | 8 名参与者的高密度重复视觉 fMRI 数据 | https://naturalscenesdataset.org/ |
| NIFD | T1w; fMRI; DTI; PET | FTD 临床与认知数据,UCSF 记忆与衰老中心 | 额颞叶痴呆及相关病变队列 | https://ida.loni.usc.edu/ |
| OASIS | T1w; PET (PiB) | 临床与认知评估、痴呆诊断、人口统计学数据 | 横断面(400+)和纵向(150+)参与者,年龄 18-96 岁 | https://www.oasis-brains.org/ |
| PNC | T1w; dMRI; ASL; rs-fMRI; task-fMRI | 基因分型、临床与神经精神评估、计算机化神经认知电池 | 青少年队列超过 9,500 人;其中 1,445 人具有神经影像数据 | https://www.med.upenn.edu/bbl/philadelphianeurodevelopmentalcohort.html |
| PPMI | T1w; rs-fMRI; DAT-SPECT; PET | 帕金森病的临床、遗传、生物样本和可穿戴传感器数据 | 约 2,000+ 名参与者,覆盖全球 30+ 个临床站点 | https://www.ppmi-info.org/ |
| REST-meta-MDD | rs-fMRI | MDD 诊断、临床与人口统计学测量 | 25 个队列共 2,428 名参与者 | http://rfmri.org/REST-meta-MDD |
| SEED-IV | EEG | 四类情绪标签、试次级会话元数据 | 15 名受试者,覆盖 3 次会话,用于情绪解码基准 | https://bcmi.sjtu.edu.cn/home/seed/ |
| SEED-VIG | EEG | 警觉性/疲劳标签、连续清醒度标注、行为元数据 | 23 名受试者的持续注意驾驶场景警觉性记录 | https://bcmi.sjtu.edu.cn/home/seed/ |
| TCP | rs-fMRI | 精神科诊断访谈、认知与临床评估 | 245 名跨诊断参与者 | https://openneuro.org/datasets/ds004215 |
| UCLA CNP | T1w; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI | 诊断分组、神经心理与表型评估 | OpenNeuro ds000030 中的 272 名参与者 | https://openneuro.org/datasets/ds000030 |
| UK Biobank | T1w; T2w; FLAIR; dMRI; rs-fMRI; task-fMRI | 基因型/基因组数据、问卷、医院记录、环境数据、社会人口学数据、体格测量 | 约 50,000 名参与者具有多模态影像数据 | https://www.ukbiobank.ac.uk/ |
- 自动依赖管理:无需手动安装,系统自动检测并解决依赖
- 真实模型执行:不仅提供文档,还引导并执行复现
- 环境隔离:虚拟环境与容器化避免系统污染
- 可验证流程:完整日志与结果追踪
- 影子检查点:基于 Git 的文件快照,支持回滚和差异对比,不污染项目仓库
- 子代理编排:生成专业子代理(生物统计学家、临床神经科学家、方法学专家)进行多视角任务执行
- 反思学习:自动反思工具失败和任务完成,持久化记忆支持跨会话学习
- 文献检索:arXiv 搜索、PubMed 获取、学术资源整合
- 实验设计:文献分析、方法学评估、研究方案生成
- 数据处理:多格式转换(DICOM ↔ NIfTI)、自动化预处理流水线
- 模型执行:运行已发表模型,深度学习框架集成
- 结果可视化:科学数据可视化、统计图表生成
- 论文写作:自动草稿生成、格式标准化
- NeuroClaw 可作为独立 Research Assistant 使用,自带 GUI 和 CLI,无需依赖其他宿主项目即可直接运行。
skills/、materials/、USER.md、SOUL.md也可以作为技能库安装到 OpenClaw、Hermes、Claude Code 等现有 agent 系统中。- 内置
core/引擎为独立部署提供完整的对话循环、技能加载器和工具运行时。 - 非神经科学连接器(WhatsApp、Telegram、Slack、日历、电商、SaaS 鉴权)
已通过
core/config/features.json默认禁用,如需启用可修改配置。
- Python >= 3.10
- Git
- (可选) Conda/Mamba,用于环境隔离
- (可选)
nvidia-smi/nvcc,用于 GPU 支持 - (推荐用于 Web UI 附件解析)
pypdf、python-docx、openpyxl、python-pptx
NeuroClaw 可独立运行,自带 GUI 和 CLI。 内置安装程序会自动配置 Python 环境、CUDA 版本、神经影像工具链和 LLM 后端。
-
克隆仓库
git clone https://github.com/CUHK-AIM-Group/NeuroClaw.git cd NeuroClaw -
运行安装向导
python installer/setup.py
该步骤会安装可直接用于 GUI 与 CLI 的独立 NeuroClaw 运行环境。 向导将引导你完成:
- Python 运行时选择(系统 Python / conda / Docker)
- CUDA / GPU 配置,以及可选的 PyTorch 自动安装
- 神经科学工具链路径(FSL、FreeSurfer、dcm2niix 等)
- LLM 后端选择(OpenAI、Anthropic 或本地模型)
- 默认 BIDS 和输出目录
- Web UI 依赖与附件解析组件(PDF/DOCX/XLSX/PPTX)
配置保存到 neuroclaw_environment.json,每次会话自动加载。
安装阶段不再要求输入 API key。请在运行时通过 --api-key 传入,或在启动前导出配置对应的环境变量。
使用自动检测默认值快速配置(无需交互):
python installer/setup.py --non-interactive如果你跳过了可选的 Web UI 依赖,可手动安装:
```bash
pip install "fastapi[standard]" uvicorn pypdf python-docx openpyxl python-pptx
```
-
启动 NeuroClaw
方式 A — 终端交互模式
python core/agent/main.py --api-key "$OPENAI_API_KEY"
**方式 B — 浏览器 Web UI**(推荐)
```bash
python core/agent/main.py --web --api-key "$OPENAI_API_KEY"
启动后在浏览器中打开 **http://localhost:7080**。Web UI 提供对话界面、技能侧边栏、Markdown 渲染和代码语法高亮。
如果你更倾向于环境变量方式,也可以先导出对应 provider 的 key,再不带 --api-key 启动。
Web UI 附件解析当前支持:
- 文本/配置/代码:`.txt`、`.md`、`.markdown`、`.json`、`.yaml`、`.yml`、`.csv`、`.tsv`、`.py`、`.js`、`.ts`、`.tsx`、`.jsx`、`.sh`、`.bash`、`.zsh`、`.sql`、`.html`、`.css`、`.xml`、`.log`、`.rst`、`.ini`、`.toml`、`.cfg`
- 文档类型:`.pdf`、`.docx`、`.xlsx`、`.pptx`
Web UI 文件选择器会限制为以上受支持格式。
如需自定义端口或绑定所有网络接口(如远程访问):
python core/agent/main.py --web --port 8080 --host 0.0.0.0 --api-key "$OPENAI_API_KEY"# 检查环境配置文件是否有效
python installer/setup.py --check
# 列出已注册的神经科学技能
python -c "
from core.skill_loader.loader import SkillLoader
from pathlib import Path
skills = SkillLoader(Path('skills')).load_all()
for s in skills:
print(s['name'])
"NeuroBench 任务位于 neurobench/,每个任务目录都包含一个 task.md 指令文件。
NeuroBench 目前接受以下几种测试设定:
with-skills:Agent 可以使用skills/目录中加载的技能no-skills:不启用技能的基线测试with-skills+no-skills配对对比:使用--benchmark-compare-skills对同一批任务同时运行两种设定
评分阶段使用 --score-benchmark 单独完成:它会读取 output/ 里的报告,使用 GPT-5.4 的加权评分规则,为计划完整性、工具/技能使用合理性以及命令/代码正确性生成分数。为保证公平,同一 task 会把所有可比模型放在同一批次联合打分,尽量降低评分标准漂移。报告里会单独记录 skill 调用次数,用于效率分析。
要对已有报告进行打分:
python core/agent/main.py --score-benchmark如果希望在较大规模结果上加速打分:
python core/agent/main.py --score-benchmark --score-workers 8Web benchmark 模式
python core/agent/main.py --web --benchmark命令行 benchmark 批处理模式
python core/agent/main.py --benchmark如果要在命令行下运行成对的 skill 对比测试:
python core/agent/main.py --benchmark --benchmark-compare-skills在命令行 benchmark 模式下,NeuroClaw 会先询问:
- benchmark 目录路径
- benchmark 模型名
然后会自动:
- 递归读取该目录下所有
task.md - 按任务文件夹名称字母顺序排序
- 逐个执行任务,中途不再要求用户确认
- 终端中只显示执行进度
- 报告按模型名保存到
output/<model_name>/目录下,并为每个 case 与 run 分别生成 markdown 报告
报告会包含思路、使用的技能、skill 调用次数,以及实际使用或建议的命令/代码。
NeuroClaw/
├── README.md # 英文版说明
├── README_zh.md # 中文版说明
├── USER.md # 用户配置与偏好
├── SOUL.md # 系统行为准则与原则
│
├── core/ # 自包含 NeuroClaw 引擎(无需 OpenClaw)
│ ├── agent/ # LLM 对话循环与工具调用调度器
│ │ └── main.py # 入口;--web 参数启动 Web UI
│ ├── web/ # 浏览器端 Web UI(FastAPI + WebSocket)
│ │ ├── server.py # FastAPI 应用:WebSocket 聊天、/api/skills、/api/env
│ │ └── static/
│ │ └── index.html # 深色主题聊天界面(Markdown + 语法高亮)
│ ├── skill_loader/ # 技能扫描器:读取 skills/*/SKILL.md 并注册工具
│ │ └── loader.py
│ ├── tool-runtime/ # 执行 handler.js / Python handlers
│ │ └── runtime.py
│ ├── session/ # 会话持久化与上下文窗口压缩
│ │ └── manager.py
│ ├── checkpoint/ # Shadow-git 文件系统检查点管理器
│ │ ├── __init__.py
│ │ └── manager.py
│ └── config/
│ └── features.json # 功能开关(禁用 WhatsApp/Slack 等;启用 web_ui)
│
├── installer/ # 自定义安装程序(替换 OpenClaw 默认向导)
│ ├── setup.py # 入口:python installer/setup.py
│ ├── config_wizard.py # 交互式 6 步配置向导(含 Web UI 依赖安装)
│ └── neuro_defaults.json # 神经科学专用默认参数模板
│
├── skills/ # 86 个技能:base (38) / subagent (42) / interface (6)
│ ├── abide-skill/
│ ├── aibl-skill/
│ ├── abcd-skill/
│ ├── academic-research-hub/
│ ├── adhd200-skill/
│ ├── adni-skill/
│ ├── aomic-skill/
│ ├── asl-skill/
│ ├── bids-organizer/
│ ├── beautiful-log/
│ ├── bnt/
│ ├── bold5000-skill/
│ ├── brain-visualization/
│ ├── brain_gnn/
│ ├── claw-shell/
│ ├── cobre-skill/
│ ├── camcan-skill/
│ ├── combraintf/
│ ├── conda-env-manager/
│ ├── conn-tool/
│ ├── dcm2nii/
│ ├── dependency-planner/
│ ├── detrending/
│ ├── dictlearning/
│ ├── dipy-tool/
│ ├── dmt-har-med-skill/
│ ├── docker-env-manager/
│ ├── dwi-skill/
│ ├── eeg-skill/
│ ├── experiment-controller/
│ ├── filtering/
│ ├── fm_app/
│ ├── fmri-skill/
│ ├── fmriprep-tool/
│ ├── freesurfer-tool/
│ ├── fsl-tool/
│ ├── git-essentials/
│ ├── git-workflows/
│ ├── glm/
│ ├── harmonization-tool/
│ ├── harness-core/
│ ├── hbn-skill/
│ ├── hcpa-skill/
│ ├── hcpd-skill/
│ ├── hcpep-skill/
│ ├── hcpya-skill/
│ ├── hcppipeline-tool/
│ ├── hierarchical/
│ ├── ibgnn/
│ ├── ica/
│ ├── ixi-skill/
│ ├── kmeans/
│ ├── knowledge-graph-builder/
│ ├── lggnn/
│ ├── method-design/
│ ├── mne-eeg-tool/
│ ├── meg-skill/
│ ├── mnd-skill/
│ ├── mschallenge-skill/
│ ├── multi-search-engine/
│ ├── neurostorm/
│ ├── nibabel-skill/
│ ├── nifd-skill/
│ ├── nsd-skill/
│ ├── nii2dcm/
│ ├── nilearn-tool/
│ ├── oasis-skill/
│ ├── overleaf-skill/
│ ├── paper-writing/
│ ├── pet-skill/
│ ├── pnc-skill/
│ ├── ppmi-skill/
│ ├── qsiprep-tool/
│ ├── research-idea/
│ ├── rest-mneta-mdd-skill/
│ ├── run_models/
│ ├── seed-iv-skill/
│ ├── seed-vig-skill/
│ ├── skill-updater/
│ ├── smri-skill/
│ ├── spacenet/
│ ├── svm/
│ ├── tcp-skill/
│ ├── ukb-skill/
│ ├── ucla-cnp-skill/
│ └── wmh-segmentation/
│
├── neurobench/ # NeuroBench 评估任务(T01-T120)
│ ├── T00_installer_validation/ # 验证安装程序输出
│ └── …
│
├── materials/ # 研究材料与参考资源
│ ├── CVPR_2026/
│ └── benchmark_results/
│
└── LICENSE # 许可证
提示:在 Web UI 的任何技能卡片上点击 ℹ️ 图标可查看展开的文档、使用示例和最近的执行日志。
| Skill | 功能 | 状态 |
|---|---|---|
dcm2nii |
DICOM → NIfTI 转换并保留元数据 | ✅ |
nii2dcm |
NIfTI → DICOM 转换以支持临床互操作 | ✅ |
git-essentials |
协作所需的核心 Git 命令 | ✅ |
git-workflows |
高级 Git 工作流(rebase/worktree/bisect) | ✅ |
multi-search-engine |
无需 API Key 的多引擎搜索 | ✅ |
conda-env-manager |
Conda 环境生命周期管理 | ✅ |
docker-env-manager |
Docker 环境管理 | ✅ |
dependency-planner |
依赖规划与安全安装流程 | ✅ |
claw-shell |
专用会话下的安全命令执行入口 | ✅ |
overleaf-skill |
Overleaf 同步与协作写作操作 | ✅ |
academic-research-hub |
多来源学术检索与论文获取 | ✅ |
bids-organizer |
原始数据组织为 BIDS 结构 | ✅ |
beautiful-log |
将 User/NeuroClaw 直接对话导出为美观 HTML 日志 | ✅ |
knowledge-graph-builder |
从文献和数据库构建领域知识图谱 | ✅ |
skill-updater |
技能更新与管理工具 | ✅ |
| Skill | 功能 | 状态 |
|---|---|---|
research-idea |
基于文献生成研究想法 | ✅ |
method-design |
形式化网络结构并推导理论组件 | ✅ |
experiment-controller |
查找并执行可复现实验 | ✅ |
paper-writing |
从 IDEA/METHOD/EXPERIMENT 生成分层稿件 | ✅ |
NeuroClaw 的子智能体包括四类:tool、model、dataset、modality。
| Skill | 功能 | 状态 |
|---|---|---|
brain-visualization |
将处理后神经影像输出转为发表级图像与 3D 资产(连接组、分区激活、FreeSurfer PLY 导出) | ✅ |
harmonization-tool |
跨站点 / 跨扫描仪特征和谐化(ComBat、ComBat-GAM、CovBat、site-as-covariate),自带 site-stratified 与 leave-site-out 切分;多站点队列 mega-analysis 的前置依赖 | ✅ |
harness-core |
核心 Harness SDK(验证、检查点、漂移检测、审计日志) | ✅ |
mne-eeg-tool |
EEG 的 MNE-Python 基础实现 | ✅ |
fsl-tool |
基于 FSL 的 sMRI/fMRI/DWI 处理工具 | ✅ |
fmriprep-tool |
fMRIPrep 流水线封装与执行 | ✅ |
qsiprep-tool |
qsiPrep 扩散 MRI 流水线封装 | ✅ |
hcppipeline-tool |
HCP 风格处理流水线工具 | ✅ |
dipy-tool |
基于 DIPY 的扩散 MRI 处理 | ✅ |
nibabel-skill |
底层神经影像文件 I/O 与几何处理(NIfTI、仿射、FreeSurfer I/O) | ✅ |
nilearn-tool |
快速影像特征提取与解码准备 | ✅ |
conn-tool |
功能连接计算与分析 | ✅ |
freesurfer-tool |
基于 FreeSurfer 的 MRI 处理与分割 | ✅ |
| Skill | 功能 | 状态 |
|---|---|---|
run_models |
模型注册与执行编排 | ✅ |
wmh-segmentation |
白质高信号分割(MARS-WMH nnU-Net) | ✅ |
brain_gnn |
BrainGNN:用于 fMRI 分类的图神经网络 | ✅ |
bnt |
BrainNetworkTransformer:基于稠密 FC 矩阵的 Transformer,配合 DEC 池化做表型预测 | ✅ |
combraintf |
Com-BrainTF:稠密 FC 输入下的两级(社区内 + 全局)社区感知 Transformer | ✅ |
ibgnn |
IBGNN:基于 PyG 的可解释 GNN,使用 MLP 消息函数并支持边遮罩解释 | ✅ |
lggnn |
LG-GNN:基于 PyG 的 GNN,集成 SABP 自注意力脑池化与互信息正则化 | ✅ |
fm_app |
FM-APP:fMRI+sMRI 多阶段表型预测 | ✅ |
neurostorm |
NeuroStorm:神经影像基础模型 | ✅ |
glm |
用于任务态 fMRI 激活分析与组水平推断的一二级 GLM | ✅ |
ica |
基于独立成分分析的静息态网络分解 | ✅ |
dictlearning |
基于字典学习的稀疏静息态网络分解 | ✅ |
svm |
基于 ROI/表格特征的经典神经影像疾病分类 | ✅ |
spacenet |
带稀疏系数图的体素级神经影像疾病分类 | ✅ |
kmeans |
基于 K-means 聚类的脑区划分 | ✅ |
hierarchical |
基于层次聚类的多尺度脑区划分 | ✅ |
filtering |
面向神经影像时序信号的时间滤波去噪 | ✅ |
detrending |
面向神经影像时序信号的时间漂移去除 | ✅ |
| Skill | 功能 | 状态 |
|---|---|---|
abide-skill |
ABIDE 数据集下载、BIDS 整理与 sMRI/rs-fMRI 处理 | ✅ |
aibl-skill |
AIBL 数据集访问、BIDS 整理与 sMRI/PET 处理 | ✅ |
abcd-skill |
ABCD Study 数据集下载、BIDS 整理与多模态处理 | ✅ |
adhd200-skill |
ADHD-200 数据集下载、BIDS 整理与 sMRI/rs-fMRI 处理 | ✅ |
adni-skill |
ADNI 数据集自动化处理流程 | ✅ |
aomic-skill |
AOMIC 数据集验证、BIDS 整理与 sMRI/rs-fMRI/task-fMRI 处理 | ✅ |
bold5000-skill |
BOLD5000 数据集 BIDS 验证与视觉任务态 fMRI 处理 | ✅ |
camcan-skill |
Cam-CAN 数据集 BIDS 验证与多模态 sMRI/rs-fMRI/task-fMRI/dMRI 处理 | ✅ |
cobre-skill |
COBRE 数据集 BIDS 整理与精神分裂症对照 fMRI 处理 | ✅ |
dmt-har-med-skill |
DMT-HAR-MED 数据集 BIDS 验证与致幻剂 rs-fMRI 处理 | ✅ |
hbn-skill |
HBN 数据集下载、BIDS 整理与多模态 sMRI/fMRI/dMRI/EEG 处理 | ✅ |
hcpa-skill |
HCP Aging 数据集下载、BIDS 整理与多模态 sMRI/fMRI/dMRI 处理 | ✅ |
hcpd-skill |
HCP Development 数据集下载、BIDS 整理与多模态 sMRI/fMRI/dMRI 处理 | ✅ |
hcpep-skill |
HCP Early Psychosis 数据集下载、BIDS 整理与多模态 sMRI/fMRI/dMRI 处理 | ✅ |
hcpya-skill |
HCP Young Adult (HCP1200) 数据集下载、BIDS 整理与多模态 sMRI/fMRI/dMRI 处理 | ✅ |
ixi-skill |
IXI 数据集 BIDS 验证与多模态 sMRI/MRA/dMRI 处理 | ✅ |
mnd-skill |
MND 数据集 BIDS 验证、rs-fMRI/task-fMRI 处理与表型数据提取 | ✅ |
mschallenge-skill |
MS 病灶挑战赛 BIDS 验证、病灶分析与纵向追踪 | ✅ |
nsd-skill |
Natural Scenes Dataset BIDS 验证、task-fMRI 处理与 COCO 刺激元数据提取 | ✅ |
nifd-skill |
NIFD 数据集 BIDS 验证与多模态 sMRI/rs-fMRI/dMRI 处理(额颞叶痴呆) | ✅ |
oasis-skill |
OASIS 数据集 BIDS 验证、sMRI 处理与表型数据提取(老化/AD 研究) | ✅ |
pnc-skill |
PNC 数据集 BIDS 验证与多模态 sMRI/rs-fMRI/task-fMRI/dMRI 处理(发育研究) | ✅ |
ppmi-skill |
PPMI 数据集 BIDS 验证与多模态 sMRI/rs-fMRI/dMRI 处理(帕金森病) | ✅ |
rest-mneta-mdd-skill |
REST-meta-MDD 多站点 rs-fMRI 处理、站点协调与抑郁症表型数据提取 | ✅ |
seed-iv-skill |
SEED-IV EEG 情绪识别(4 类情绪)、特征提取与分类 | ✅ |
seed-vig-skill |
SEED-VIG EEG 警觉度/疲劳检测、特征提取与困倦分类 | ✅ |
tcp-skill |
Transdiagnostic Connectome Project BIDS 验证与多模态 sMRI/rs-fMRI/dMRI 处理 | ✅ |
ucla-cnp-skill |
UCLA CNP BIDS 验证、多模态 sMRI/task-fMRI/dMRI 处理与多障碍表型分析 | ✅ |
ukb-skill |
UKB 脑影像自动化处理流程 | ✅ |
| Skill | 功能 | 状态 |
|---|---|---|
eeg-skill |
EEG 预处理与特征提取流程 | ✅ |
fmri-skill |
功能 MRI 预处理与分析流程 | ✅ |
smri-skill |
结构 MRI 预处理与分析流程 | ✅ |
dwi-skill |
扩散 MRI 预处理与分析流程 | ✅ |
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PET 影像处理流程(SUVR 计算、参考区域、部分容积校正) | ✅ |
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ASL 灌注 MRI 处理流程(CBF 量化、Buxton 模型) | ✅ |
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MEG 处理流程(源定位、时频分析、连接性) | ✅ |
图例:✅ 已实现 | 🏗️ 开发中 | ⏳ 规划中
感谢:
- OpenClaw
- Hermes
- Claude Code
- Karcen/rs-fMRI-Pipeline-Tutorial
- nature-skills
- 开源神经科学工具社区(MNE-Python、FreeSurfer、FSL 等)





