BUG: Доработать команды и функции

Нужно доработать команду `prufer`, а также нужно исправить функции по поиску матрицы кратчайших путей по алгоритму Флойда-Уоршелла. Также, добавить команды, которые создают графы - создание `JSON`-файла этого созданного графа. Например, `algorithm --skeleton-tree GRAPH_NAME` возвращает граф, но не файл графа, т. е. чтобы нарисовать остовное дерево, нужно вводить его вручную