关于候选基因关联分析结果的表格，标注的灰色位点是通过哪些观察哪些数据筛选出来的？（应为看到表格中有许多的p值，有些显著性似乎并不是最合适的）这个位点是否即意味着在这个数据中其实最有研究意义的位点？

[CropCoder]

关于候选基因关联分析结果的表格，标注的灰色位点是通过哪些观察哪些数据筛选出来的？（应为看到表格中有许多的p值，有些显著性似乎并不是最合适的）这个位点是否即意味着在这个数据中其实最有研究意义的位点？

[CropCoder]

您好，感谢您使用SGAT！

以下是对您提问的答复：

1. 标注灰色的位点是通过观察关联分析结果的显著性和变异位点之间的LD连锁不平衡程度进行筛选的，通常连锁程度比较低的点（R2比较小）使用灰色进行标注。
2. 表格中的显著性只能说明该位点与当前的表型之间无显著差异，还需要结合单标记分析结果和单倍型聚类结果进行分析哈。
3. 个人推荐选择关键突变（引起氨基酸变化的错义突变），同时连锁程度比较高，单倍型差异分析有显著性，候选基因分析显著的位点进行下一步分析。

最后，祝您科研顺利~