- Windows 10 或 11
- Python 3.8+（已安装并加入 PATH）
- 已安装项目依赖：
pip install -r requirements.txt，以及pip install parasail
建议：若当前环境安装了大量科学计算库（如 pandas、torch、tensorflow），打包会较慢且 exe 较大。可新建虚拟环境只装必要依赖再打包：
python -m venv venv_build
venv_build\Scripts\activate
pip install -r requirements.txt parasail pyinstaller
pyinstaller --noconfirm GeneType.spec-
打开命令提示符或 PowerShell，进入项目目录：
cd D:\workplace\GeneType -
双击运行
build_exe.bat，或在命令行执行：build_exe.bat
脚本会自动安装 PyInstaller（若未安装）、检查依赖并打包。
-
打包完成后，可执行文件位于：
dist\GeneType.exe
说明：spec 中已通过 collect_all('parasail') 打包 parasail.dll。若未打包该 DLL，exe 内 parasail 无法加载，会走 Biopython 等回退比对，结果会与直接运行 python genotype_gui.py 不一致。打包后建议用同一批数据对比 exe 与 Python 结果是否一致。
- 无需安装 Python，将
GeneType.exe复制到任意 Windows 10/11 电脑即可运行。 - 建议将
GeneType.exe与known_polymorphisms.txt放在同一目录（若需使用已知多态性过滤）；exe 内已包含该文件，运行时优先使用 exe 内嵌版本。 - 参考序列（.dna）和测序文件（.ab1）由用户在界面中选择，无路径限制。
- 首次运行若杀毒软件提示，请选择“允许”或“信任”（PyInstaller 打包的程序可能被误报）。
重新打包前：请先关闭正在运行的 GeneType.exe，否则会报「拒绝访问」无法覆盖 dist 下的 exe。
PyInstaller 生成的 exe 常被 Windows Defender 误报。若打包在「Copying icon to EXE」阶段报错，请先排除项目目录再打包：
- 打开 Windows 安全中心 → 病毒和威胁防护 → 管理设置 → 排除项 → 添加或删除排除项
- 添加排除项 → 文件夹 → 选择项目目录（如
D:\workplace\GeneType） - 重新执行打包：在项目目录下打开 PowerShell 或 命令提示符，执行：
pyinstaller --noconfirm GeneType.spec
- 打包完成后，exe 在
dist\GeneType.exe。分发到其他电脑时，若对方杀毒软件提示，选择「允许」或「信任」即可。
若需自定义打包参数，可手动执行：
pip install pyinstaller
pyinstaller --noconfirm GeneType.spec或不用 spec 文件：
pyinstaller --onefile --windowed --name GeneType ^
--add-data "known_polymorphisms.txt;." ^
genotype_gui.py（Windows 下 --add-data 使用分号 ; 分隔路径与目标目录。）