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Commit 1f41a48

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Change in partition for SLURM submission
1 parent bc683ff commit 1f41a48

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4 files changed

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lines changed

src/07-programas-e-aplicativos/circos/README.md

Lines changed: 2 additions & 2 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -70,9 +70,9 @@ A execução do Circos no HPCC Marvin é feita por meio de scripts de submissão
7070
```bash
7171
#!/bin/bash
7272
#SBATCH --job-name=circos
73-
#SBATCH --partition=short-gpu-small
73+
#SBATCH --partition=short-cpu
7474
#SBATCH --ntasks=1
75-
#SBATCH --cpus-per-task=8
75+
#SBATCH --cpus-per-task=4
7676
#SBATCH --mem-per-cpu=2GB
7777

7878
module load circos/0.69-10

src/07-programas-e-aplicativos/fastqc/README.md

Lines changed: 1 addition & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -44,7 +44,7 @@ Para executar o fastqc, são necessários os seguintes passos:
4444

4545
2. Em `Interactive Apps`, abra uma `VNC`.
4646

47-
3. No formulário da VNC, selecione uma das partições `gui-gpu-small` ou `gui-gpu-big` e defina o número de horas, número de GPUs e número de CPUs conforme necessário. Clique em `Launch`.
47+
3. No formulário da VNC, selecione uma das partições `gui-cpu`, `gui-gpu-small` ou `gui-gpu-big` e defina o número de horas, número de GPUs e número de CPUs conforme necessário. Clique em `Launch`.
4848

4949
4. Uma nova janela será aberta com a VNC. Aguarde até que a VNC esteja ativa (`Running`) e clique em `Launch VNC`.
5050

src/07-programas-e-aplicativos/hic2cool/README.md

Lines changed: 1 addition & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -48,7 +48,7 @@ A execução do hic2cool no HPCC Marvin é feita por meio de scripts de submiss
4848
#SBATCH --job-name=hic2cool
4949
#SBATCH --partition=short-cpu
5050
#SBATCH --ntasks=1
51-
#SBATCH --cpus-per-task=8
51+
#SBATCH --cpus-per-task=4
5252
#SBATCH --mem-per-cpu=2GB
5353

5454
module load hic2cool/1.0.1

src/07-programas-e-aplicativos/procheck/README.md

Lines changed: 2 additions & 2 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -68,9 +68,9 @@ A execução do Procheck no HPCC Marvin é feita por meio de scripts de submiss
6868
```bash
6969
#!/bin/bash
7070
#SBATCH --job-name=procheck
71-
#SBATCH --partition=short-gpu-small
71+
#SBATCH --partition=short-cpu
7272
#SBATCH --ntasks=1
73-
#SBATCH --cpus-per-task=8
73+
#SBATCH --cpus-per-task=4
7474
#SBATCH --mem-per-cpu=2GB
7575

7676
module load procheck/3.5.4

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