paracetamol-for-AKI-PARIST-trial-work-flow/.gitignore at main · gpaasi/paracetamol-for-AKI-PARIST-trial-work-flow · GitHub

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#  PARIST Trial • Git ignore list                                             #
#  Covers: R, RStudio, renv, LaTeX, pandoc, macOS/Windows cruft, data, docs   #
###############################################################################

########################
# 1.  R / RStudio artefacts
########################
.Rhistory
.Rapp.history
.RData
.Ruserdata
.Rproj.user/

# renv local library and build folders
renv/library/
renv/staging/

# Packrat (if ever used)
packrat/
packrat.lock

########################
# 2.  Quarto / R Markdown / knitr cache
########################
*_cache/
*/cache/
*.utf8.md
*.knit.md

########################
# 3.  LaTeX & pandoc intermediates
########################
*.aux
*.bbl
*.blg
*.brf
*.fls
*.fdb_latexmk
*.lof
*.log
*.lot
*.out
*.synctex.gz
*.toc
*.run.xml
*.dvi

########################
# 4.  Figures that are re-generated by scripts
########################
figures/**/*.png
figures/**/*.pdf
figures/**/*.svg

########################
# 5.  Operating-system cruft
########################
.DS_Store
Icon?
Thumbs.db
ehthumbs.db
Desktop.ini

########################
# 6.  Editor / IDE settings
########################
.vscode/
.idea/
*.sublime-workspace
*.sublime-project

########################
# 7.  Python / Jupyter (just in case)
########################
__pycache__/
*.py[cod]
.ipynb_checkpoints/

########################
# 8.  Raw sensitive data  (NEVER COMMIT)
########################
data/raw/
data/raw/**

########################
# 9.  Build artefacts / rendered docs
########################
docs/
*.html
*.pdf

########################
# 10.  Misc backups
########################
*~
*.swp
*.bak
*.tmp