Update to use latest c302, sibernetic

Author: pgleeson

Dockerfile

@@ -59,7 +59,7 @@ RUN sudo pip install neuron==8.2.6  --break-system-packages
 
 RUN git clone https://github.com/openworm/c302.git && \
   cd c302 && \
-  git checkout ow-0.9.7 && \
+  git checkout ow-0.9.8 && \
   sudo pip install .  --break-system-packages
 
 # Note: pyNeuroML installed with the above library
@@ -71,7 +71,7 @@ RUN git clone https://github.com/openworm/c302.git && \
 
 RUN git clone https://github.com/openworm/sibernetic.git && \
   cd sibernetic && \
-  git checkout ow-0.9.7  # fixed to a specific branch
+  git checkout ow-0.9.8a  # fixed to a specific branch
 
 
 ################################################################################
@@ -116,6 +116,12 @@ RUN cd sibernetic && \
     make clean && make all && ldd ./Release/Sibernetic  # Use python 3 libs
 
 
+################################################################################
+########     Set up JupyterLab
+
+#RUN sudo pip install notebook jupyterlab --break-system-packages
+
+
 ################################################################################
 ########     Copy master python script
 
@@ -125,6 +131,9 @@ RUN sudo chown $USER:$USER $HOME/master_openworm.py
 
 RUN printf '\n\nalias cd..="cd .."\nalias h=history\nalias ll="ls -alth"\n' >> ~/.bashrc
 
+
+
 RUN pip list
 
 RUN echo "Built the OpenWorm Docker image!"
+