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1_Ferramentas.org

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#1 Instalação de Ferramentas com Spack

#1.1 Introdução

Utilizaremos o gerenciador de pacotes spack para obter, configurar, compilar e instalar programas e bibliotecas sem permissões especiais de superusuário. Nesta seção, ilustraremos o funcionamento da ferramenta com apenas um pacote, um tutorial mais detalhado (em inglês) pode ser encontrado neste link.

Primeiramente, precisamos baixar o spack a partir do repositório git oficial conforme instruções abaixo. Note que o comando source permite colocar o caminho para spack no PATH do terminal.

git clone -b v0.14.2 https://github.com/spack/spack.git
source spack/share/spack/setup-env.sh

Com o spack podemos instalar diversas ferramentas, incluindo compiladores. A lista de pacotes disponíveis pode ser obtida com o comando spack list. Por motivos de espaço, ilustramos abaixo como listar os pacotes cujo nome inicia com h.

cd spack
spack list h*
==> 50 packages.
h5hut    h5z-zfp      halc     haploview  hc    hdf5-blosc  hepmc    highfive     hisat2  homer       hpctoolkit  hpl   hsakmt  htslib  hugo      hybpiper  hyphy
h5part   hacckernels  hapcut2  harfbuzz   hdf   help2man    heppdt   highwayhash  hisea   hoomd-blue  hpcviewer   hpx   hstr    httpie  hunspell  hydra     hypre
h5utils  hadoop       hapdip   harminv    hdf5  henson      hic-pro  hiop         hmmer   hpccg       hpgmg       hpx5  htop    hub     hwloc     hydrogen

#1.2 Instalação do pacote de álgebra linear Chameleon

O pacote Chameleon não está disponível no repositório padrão do spack. Dessa forma, primeiramente deve ser obtido o reposiório apropriado com:

git clone https://gitlab.inria.fr/solverstack/spack-repo.git

O novo repositório pode ser adicionado ao spack com:

spack repo add spack-repo

Em seguida, podemos proceder com a instalação:

spack install chameleon@0.9.2+starpu~mpi~cuda ^starpu@1.3.1~fast~mpi~cuda~openmp~examples

Observe que o comando de instalação especifica tanto a versão do Chameleon (0.9.2) quanto da dependência StarPU (1.3.1).

Note que, além do StarPU, o pacote Chameleon possui diversas outras dependências que serão gerenciadas automaticamente pelo spack. O comando spack spec pode ser usado para conferir quais dependências serão instaladas:

spack spec chameleon@0.9.2+starpu~mpi~cuda ^starpu@1.3.1~fast~mpi~cuda~openmp~examples

O comando spack location fornece o caminho para a instalação de uma versão específica. O spack permite que várias instalações de um mesmo software coexistam.

spack location -i chameleon@0.9.2+starpu~mpi~cuda ^starpu@1.3.1~fast~mpi~cuda~openmp~examples

O comando abaixo permite instalar uma segunda versão do Chameleon, habilitando o suporte à MPI.

spack install chameleon@0.9.2+mpi+cuda