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Open Science - 科学 AI エージェントを備えたオープンソースの AI 研究ワークベンチ

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このドキュメントは英語版 README.md の翻訳です。内容に相違がある場合は、英語版が優先されます。

Open Science は、AIPOCH が科学者と研究者向けに開発した、オープンソースかつローカルファーストでモデル非依存の AI 研究ワークベンチです。科学 AI エージェント、Python と R の実行、科学データコネクタ、macOS・Windows・Linux のクロスプラットフォーム対応により、再現可能で検証可能な研究を実現します。1 つのワークスペースでプロジェクトを作成し、研究目標を自然言語で説明するだけで、エージェントがファイルの読み取り、ウェブ検索、コード実行、科学データソースへの問い合わせを行い、追跡可能な来歴を備えたレポート、表、図を生成します。

Open Science は、機械学習、統計学、生命科学、化学、材料科学、物理学、環境科学など、幅広い分野の計算集約型・データ集約型研究を支援します。文献レビューと仮説構築から、コード実行、データ分析、シミュレーション、可視化、追跡可能な研究成果の作成まで、研究プロセス全体を支えます。

💡 Open Science v0.24.0 をリリースしました (最終更新:2026 年 8 月)。Open Science v0.24.0 では、プロジェクト間の移動がより速くなり、コードの実行がより安全になりました。ワークスペースメニューのプロジェクトクイックスイッチャー、承認したドメインに限定され、新しい宛先は会話内で承認する Notebook とコンピューティングのネットワークアクセス(Windows では、サンドボックスの一度限りの管理者によるセットアップが完了すると有効になります)、カスタムコネクタがバインドできるデバイス全体の共有資格情報、ワンクリックで復元できる安全なデフォルト権限、そしてドイツ語インターフェース — あわせて、Notebook とコンピューティングの実行による不変のファイル世代、強化されたリモートコンピューティングジョブ、ランタイム・コネクタ・ストレージに関する幅広い修正にも対応します。詳細は最新リリースノートを参照してください。

生成されたアーティファクトを含むエージェントセッションを表示する Open Science のオープンソース AI 研究ワークベンチ

目次

🚀 クイックスタート

3 つの手順で Open Science を実行できます。使用するプラットフォームのインストーラーをダウンロードし、初回起動ガイドを完了して、研究プロジェクトを作成します。

1. アプリをダウンロードする

最新リリースを開いて Assets を展開し、コンピューターに合うインストーラーを選択します。

コンピューター 選択するもの
macOS — Apple Silicon(M1 以降) Apple Silicon / ARM64 用 macOS DMG
macOS — Intel Intel / x64 用 macOS DMG
Windows x64 Windows x64 インストーラー
Linux x64 Linux x64 AppImage または Debian パッケージ

リリースページに掲載されたアセットと検証情報を確認してください。インストール前にパッケージを検証する場合は、ダウンロードの検証を参照してください。

macOS または Windows に未確認の開発元や不明な発行元の警告が表示された場合は、続行前にパッケージが公式 Releases ページから取得されたことを確認してください。

2. 初回設定を完了する

初回起動には 5 つのガイド付き手順があります。

  1. 環境で、互換性、アプリのストレージ、安全な認証情報ストレージ、ネットワークアクセスを確認します。
  2. データの場所で、大きなアーティファクト、Notebook、アップロード、環境の保存先を選択します。
  3. エージェントランタイムで Claude Code、OpenCode、Codex のいずれかを選択して準備します。アプリ管理ランタイムのインストールには Node.js、npm、管理者パスワードは不要です。
  4. モデルプロバイダーで使用するモデルに接続してテストします。組み込みプロバイダー、カスタムゲートウェイ、既存の Claude または Codex サブスクリプションログインを選択できます。
  5. Notebook ランタイムでは、アプリ管理の Python・R 環境を任意で準備するか、検出または手動登録した各言語のインタープリターを有効にします。
Open Science の自動初回環境チェック Open Science の初回モデルプロバイダー設定
ホスト互換性、ストレージ、ネットワークのチェック プロバイダー、API Key、エンドポイント、モデルの検証

Notebook の実行は任意です。必要な環境チェックとエージェントランタイムチェックがすべて成功すると Continue が有効になり、モデル接続が成功すると設定を完了できます。Notebook とデータの場所はデフォルトのままにして、後から設定で変更できます。

3. 研究プロジェクトを始める

  1. New project をクリックし、プロジェクトに安定した研究名と任意の説明を付けます。
  2. セッションを開き、目標、入力データ、制約、必要な出力、結果の確認方法を説明します。
  3. ソースファイルを添付し、検証済みモデルと承認モードを選択します。
  4. タスクを送信します。エージェントのツールアクティビティを確認し、機密性の高い操作を承認して、生成されたアーティファクトをプレビューパネルで開きます。
  5. 別の方向を検討するには、以前のユーザーメッセージを編集して新しいブランチで再送信します。メッセージのリビジョンコントロールからどちらの経路にも戻れます。
  6. アーティファクトの Provenance ビューを開き、バージョンと選択結果の根拠を確認します。
  7. 後のセッションでも作業を続けられます。@ で既存のプロジェクトファイルを参照し、/ で有効なスキルを明示的に選択します。

この README のスクリーンショットはワークフローの例です。ラベル、カタログ、その他のインターフェースの詳細は、インストールしたバージョンと異なる場合があります。

製品ツアー

Open Science は研究をプロジェクトとセッションに整理し、すべての結果をその根拠に結び付けます。以下では、ワークスペース、アーティファクトの来歴、プレビュー、科学スキル、データコネクタを紹介します。

タスクから追跡可能なアーティファクトまでを扱う 1 つのワークスペース

プロジェクトには、関連するセッション、アップロード、生成ファイル、プレビュー状態がまとめて保存されます。会話にはエージェントの回答に加え、その回答を生成したコマンド、ファイル読み取り、編集、検索、コネクタ呼び出しが記録されます。生成された各アーティファクトは、チェックサム付きの不変バージョンとして保存されます。Provenance ビューには、作成時に Open Science が検証できた生成コードと実行履歴、参照入力、観測された環境インベントリ、生成元の会話ブランチ、バージョン固有のレビュー結果が表示されます。欠けている根拠は推測で補われず、利用不可と明示されます。

アップロードと生成された研究アーティファクトを含むプロジェクトファイルライブラリ 完了したエージェントセッションの横に表示される CSV アーティファクトプレビュー
プロジェクトとセッション別に整理されたアップロードと生成ファイル データと研究履歴を並べて表示するネイティブプレビュー

生成されたレポート、図、表はセッションに関連付けられたまま、プロジェクトのファイルライブラリにも集約されます。パネルの大きさが変わってもプレビュータブはアクティブな結果を表示し、長い名前では識別に必要な末尾と拡張子が保たれます。Open Science は一般的な科学データ、PDF、Office ドキュメント(DOCX、XLSX、PPTX)、画像(ズームとパン対応)、シンタックスハイライト付きソースコード、分子構造と反応、Notebook 履歴をプレビューします。プレビュー制限によって基のファイルが切り詰められることはなく、完全なアーティファクトをエージェントや外部ツールから利用できます。Cmd/Ctrl+F でワークスペース全体のトランスクリプト、Notebook 出力、レンダリング済みページを検索し、Cmd/Ctrl+K でプロジェクトスコープのコマンドパレットを開けます。Settings → General でテーマを切り替えると、シェル、トランスクリプト、レンダラーの配色がちらつかずに切り替わります。インターフェースは設定のランタイム言語切り替えにより、ドイツ語、簡体字中国語、繁体字中国語、日本語、韓国語、フランス語、ロシア語、スペイン語でも利用できます。

元の内容を失わずに会話を分岐する

完了したユーザーメッセージを編集し、その時点から変更したプロンプトを再送信できます。Open Science は後続ターンを削除せずに新しいメッセージブランチを作成し、リビジョンコントロールで元の経路と別の経路を切り替えられます。ブランチ選択、ツールアクティビティ、添付ファイル、生成アーティファクトは、プロジェクトの切り替えや再起動後も保持されます。来歴は各アーティファクトバージョンを生成した正確なブランチに結び付いたままなので、別の仮説を検討しても以前の結果の記録が曖昧になりません。

科学スキルとデータコネクタ

Open Science には、増え続ける 18 個の注目ファイルベース研究スキルがあります。AlphaFold2、Boltz、Borzoi、Chai-1、DiffDock、Environment & Packages、ESM-2、ESMFold2、Evo 2、Indication Dossier、LigandMPNN、Literature Review、OpenFold3、ProteinMPNN、scGPT、scvi-tools、SolubleMPNN、およびリモート HPC クラスターで長時間ジョブを送信・回収する Remote Compute (SSH) です。個人スキルの作成、SKILL.md/ZIP/.skill パッケージのアップロード、任意の認証を使った GitHub からの互換スキルのプレビューとインポート、グローバルエージェントディレクトリにインストール済みのスキルのインポートができます。エージェントがセッション添付ファイルや公開 GitHub URL からパッケージのインポートを要求することもでき、アプリが管理するプレビューと確認を経てから書き込まれます。有効なスキルはコンポーザーで / から直接選択できます。

また、24 個の組み込み研究コネクタがあります。Literature Graph、PubMed、bioRxiv、Genes & Ontologies、Genomes、BioMart、Variants、Human Genetics、Clinical Genomics、Structures & Interactions、Protein Annotation、Expression、Omics Archives、CellGuide、Regulation、RNA、Chemistry、ChEMBL、ZINC、Molecule Viewer、Clinical Trials、Drug Regulatory、Cancer Models、Research Resources です。組み込みコネクタとカスタムコネクタは権限システムで保護され、ツールごとに Always allowAsk each timeBlock を設定できます。インストール済みアプリには現在のスキル、コネクタ、ツールのカタログが表示されます。

注目の科学スキルを表示する Open Science の設定 組み込み科学データコネクタを表示する Open Science の設定
読みやすく再利用可能な研究スキル 権限付きエージェントツールとして公開される科学データベース

Open Science を選ぶ理由

Open Science は、研究タスク、実行、ファイル、根拠を 1 つのローカルで検証可能なデスクトップワークスペースにまとめます。

研究作業は通常、チャットウィンドウ、Notebook、ローカルスクリプト、科学データベース、ファイルブラウザー、レポートツールに分散しています。引き継ぎのたびにコンテキストが失われ、回答と、それを生み出したコードやファイルが切り離されがちです。

Open Science はそれらを 1 つの検証可能なデスクトップワークスペースに統合します。

  • 作業を永続化。 プロジェクト、セッション、下書き、ファイル、プレビュー、実行履歴はアプリの再起動後も残ります。
  • 提案だけでなく実行。 ユーザーの承認のもと、エージェントはコマンド、Python、R の実行、ファイル編集、検索、コネクタ呼び出し、アーティファクト生成を行えます。
  • 作業を失わず別の経路を検討。 以前のプロンプトを新しいメッセージブランチで変更し、複数の研究方向を切り替えられます。
  • 追跡可能な結果。 不変アーティファクトバージョンは Open Science が検証できる生成根拠を保持し、検証できない根拠も明示します。
  • 複数のモデル選択肢。 組み込みクラウドプロバイダー、互換カスタムゲートウェイ、Claude または Codex サブスクリプションを使用し、コンポーザーでセッションごとにモデルと推論の強度を選べます。
  • ローカルファーストの所有権。 アプリとプロジェクト状態は自分のコンピューターで動作し、外部呼び出しは明示的に設定または承認したサービスだけに行われます。
  • 検証可能性。 ソースコード、スキル、コネクタ定義、ツールアクティビティ、生成ファイル、アーティファクトの来歴を確認できます。
  • 拡張性。 閉じたプラグインロードマップを待たずに、スキルと MCP コネクタを追加できます。
  • シートライセンス不要。 Open Science は Apache-2.0 ソフトウェアです。選択したモデルやインフラストラクチャーの料金だけを支払います。

Open Science はゼロから構築した独立製品です。他の AI 研究アプリのプロキシ、非公式クライアント、外観だけを変えた製品ではありません。

設計原則

Open Science は、コード、データ、モデル、人による監督の関係を定める 7 つの設計原則に基づきます。デフォルトでオープン、明示的なマルチプロバイダー互換性、ローカルファーストのデータ所有権、ヒューマンインザループの監督、永続的な研究記録、組み合わせ可能な機能、誠実な科学的境界です。

  • デフォルトでオープン。 ソースコード、形式、コネクタ、スキルは検証とフォークが可能であるべきです。
  • 互換性を明示するマルチプロバイダー対応。 すべての API プロトコルを交換可能とみなさず、プロバイダー設定を検証してエンドポイント要件を示します。
  • ローカルファーストでデータを意識。 プロジェクト状態をローカルに保ち、外部データフローを示し、自律動作をオプトインにします。
  • ヒューマンインザループ。 ファイル編集、コマンド、ネットワークアクセス、コネクタ呼び出しは明示的な承認プロファイルで制御されます。
  • 永続的な研究記録。 セッション、ツールアクティビティ、Notebook 履歴、不変アーティファクトバージョンは実行後も確認でき、利用できない根拠は明記されます。
  • 組み合わせ可能な機能。 スキル、コネクタ、モデル、プレビュー、将来のコンピューティングバックエンドは、1 つのブラックボックスではなく交換可能な部品です。
  • 誠実な科学的境界。 生成出力は専門家の判断、統計レビュー、一次資料に基づく検証の代わりにはなりません。

主な機能

Open Science は、プロジェクト管理、マルチモデルエージェント実行、Python・R Notebook、科学データコネクタ、来歴付きの不変アーティファクトバージョン、権限で管理されたヒューマンインザループ制御を、1 つのローカルワークスペースに統合します。変更されるカタログ、パッケージングの詳細、新しい選択肢については、インストール済みアプリと最新リリースノートが正確な情報源です。

分野 主な機能
プロジェクトとセッション プロジェクトの作成・名前変更・削除、ピン留め可能な複数セッション、元の後続経路を削除せずに完了済みプロンプトを永続的で選択可能なメッセージブランチへ編集、セッション内の永続サイド会話、生成して編集できるセッション詳細(タイトルと説明)、最近の作業・下書き・会話履歴・プレビュー状態の復元。
エージェントワークフロー 自然言語タスク、ストリーミング応答、宣言した目的でグループ化された型付きツールアクティビティカード、カテゴリ別推定を含むライブコンテキスト使用量、オンデマンドのコンテキスト圧縮、再起動後の永続化、停止と承認待機、実行中の終了確認と記憶される設定、フォローアップ用コンポーザーメッセージキュー、統一された下書きの取り消し・やり直し履歴、完了したエージェントメッセージからの新規セッション分岐、注意理由付きデスクトップ通知・永続未読バッジ・ブロッキング承認のネイティブ通知、既読状態と削除済み対象を保持する通知センター、複数質問用の構造化確認カード(質問ごとの回答レビュー付き)、選択したテキスト・画像・PDF をコンテキストとして会話に送るアノテーション(選択したテキストや領域は、ソース文書内でクリックして該当箇所を表示できます)、ターン間のエージェント構成変更を示すタイムラインマーカー、展開時に読み込まれたスキルドキュメントを表示するスキル読み込み行、最大 3 つの PDF をリンクしてエージェントが現在のページの読み取り、ドキュメント全体のページ送り、横断検索を行えるセッション読解コンテキスト、プロジェクト単位の知識をセッションをまたいで呼び出す永続エージェントメモリー、エージェント応答内のソースリンクのアプリ内安全プレビュー、ホームのライブセッション状態、経過時間と使用量を含むメッセージメタデータ、ターン別トークン使用量(モデル呼び出しごとの使用量の詳細と呼び出し単位のコンテキストウィンドウチャートを含む)、完了ターンのフレームワークとモデル表示、プロジェクトスコープのコマンドパレット・フレーム読み取り・操作・コンテキスト、ワークスペースのプロジェクトメニューで他のアクティブなプロジェクトをタイトルと説明のプレビュー付きで一覧表示するプロジェクトクイックスイッチャー、セッションのタイトルと説明のホバープレビュー付きの改善されたセッション行、他セッションを参照するセッション参照(#、ターン単位の読み取り専用アクセス)、実行中のメインターンへのサイドチャット助言の注入、グローバル検索でのセッション番号検索、永続実行契約と CLI の表示・承認・拒否を備えたレビューゲート付きセッションプラン、滑らかなライブ表示、折りたたみ可能なサイドパネル、新規会話ショートカット、再起動で中断したセッションの回復。
サブエージェント委任 永続メッセージと回復を備えた本番用サブエージェント委任。
モデル 組み込みクラウドプロバイダー、カスタム互換ゲートウェイ、Claude・Codex サブスクリプションログイン、接続検証、モデル別マルチモーダル画像入力、モデルと対応する推論の強度をまとめたセッション単位のコンポーザー選択、サブエージェント/レビューアー/ビジョンポリシーをまとめたシナリオモデルカード、新しいセッション向けの設定デフォルト、テキスト専用バックエンド向け永続画像エビデンスリレーを備えた専用 Vision モデル選択。プロバイダーと API 形式は選択したエージェントバックエンドに対して検証されます。
エージェントバックエンド Claude Code、OpenCode、Codex、ログイン不要の CodeBuddy から選べるエージェントフレームワークで、同じワークスペースを複数の基盤エージェント実装で動作させ、バックエンドに対するプロバイダー・モデル検証、設定からのアプリ管理バックエンドのインストール・切り替え・削除、切り替えや再開後に各フレームワークのコンテキスト経路を尊重するエージェント対応リプレイ。
スペシャリスト スコープ付き機能を持つ個人スペシャリストエージェントプロファイル、メインエージェントから実行中に行う即時ハンドオフ、会話によるカスタマイズ、パッケージのインポート・エクスポート、不変呼び出し ID、検証可能な上書きを備えた名前ベース ID 生成、署名検証・公式およびユーザー承認済み GitHub ソース・CDN フォールバック・進行状況・インポート時のスキル競合解決を備えたスコープ限定マーケットプレイス。マーケットプレイスは「インストール済み」と「マーケットプレイス」を分け、カードグリッドとフィルタチップを備え(単一の主要閲覧入口と明確な戻りパス付き)、検証済みキャッシュ一覧を即時に表示して手動更新でき、詳細から直接インストールできます。共通機能アイコン、外観のクイック編集、機能行ナビゲーションも備えます。
機能の整理 スキル、コネクタ、実行可能なスペシャリストを横断するタグ、保護された「お気に入り」タグ、割り当てメニュー、バッジ、フィルター、検索可能なタグ設定ブラウザー、ポインターまたはキーボードによる永続的なドラッグ並べ替え。
実行 永続コード・出力履歴を持つ Python、R、REPL コントロールプレーンカーネルと、同じ実行履歴に記録されるステートレスなシェルコマンド、Notebook とコンピューティングのランタイムからの送信ネットワークアクセス(Open Science のデフォルトとユーザー承認済みドメインに限定し、ブロックされた宛先は会話内で承認)、エージェント評価用の制限付き REPL 推論、オフラインプロビジョニング対応のアプリ管理環境、持ち込み Python・R インタープリター、鍵またはパスワード認証と OS 暗号化資格情報の保存に対応した追加実行先のリモート SSH コンピューティングホスト(Windows でのパスワード認証を含む)、エージェントと共有するユーザーターミナル(入力中に実行中カーネルの変数名をリアルタイムで候補表示)、環境別の読み取り専用インストール済みパッケージ一覧、実行中の Python/R カーネル向けの読み取り専用ライブ変数ブラウザー、エージェントがファイルを調べるための Notebook アーティファクト読み取り、経過時間付きのパッケージインストール進行状況、長時間実行 Notebook の段階的履歴読み込み。外部 R ランタイムのパッケージ管理は手動です。
入力とファイル 1 ファイル最大 10 GB のストリーミング添付、インデックス付きページング・セッショングループ・ソース限定ファイル名検索・グリッド/リスト表示・大規模プロジェクト用モーダルを持つプロジェクトライブラリ、セッション横の分割プレビュー、生成アーティファクトカード、既存アップロードや出力への @ 参照、ドライブをまたぐ閲覧・編集可能なパスバー・ドライブ切り替えを伴うローカルフォルダー権限の @path メンション、ダウンロードとエクスポート、選択的セッションアーティファクトダウンロード、正確に復元できる長いテキスト貼り付け添付、Markdown/PDF 会話エクスポート、タブ別または一括の .ipynb セッションエクスポート。
アーティファクトと来歴 チェックサム、利用可能な生成コード、実行履歴、正確な入力参照、環境インベントリ、生成メッセージブランチ、系譜アクセス、バージョン固有レビュー根拠を備えた不変かつセッションスコープのアーティファクトバージョン。バージョン移動と関連根拠への直接リンクに対応します。
プレビュー形式 科学データ、選択可能なテキスト、領域選択、目次とサムネイルによるナビゲーション、ドキュメント検索、ページ移動を備えた PDF、Office ドキュメント(DOCX、XLSX、PPTX)、TIFF を含むズーム・パン対応画像、シンタックスハイライト付きコード、分子構造と反応、Notebook 履歴のレスポンシブなマルチタブプレビュー。インラインまたは全画面表示と、生成元会話へのコンテキスト内ナビゲーションに対応します。
ローカルデータ管理 ローカルのプロジェクト・アプリデータ、Notebook ワークロードキャッシュも引き継ぐ設定可能なストレージ場所、ガイド付き移行、システム・手動・直接モードを持つグローバルプロキシ設定、期間集計・30 日アクティビティヒートマップ・日別入力/キャッシュ/出力グラフに加え、実行単位の使用量帰属と、メイン会話の外で行われるモデル呼び出し(サイドチャット、デリゲーション、コンパクション)の集計を備えたトークン使用量ダッシュボード。
スキル 18 個の注目組み込みスキル、不変の小文字ハイフン名を持つ個人スキル、セッション内の自然言語による作成、完了会話ターンからのスキル保存、外部パッケージ検証を伴う直接ユーザースキルフォルダー、ソース・状態・テキストフィルター付き一括有効/無効管理、アップロード、認証付き GitHub プレビュー/インポート、候補プレビュー付きグローバルスキル取り込み、添付や GitHub URL からのエージェント要求インポート、構造化検証付き camelCase Host JavaScript API、登録済みのスタイリング・構成・論文ナラティブヘルパーを備えた来歴対応図表ワークフロー、有効/無効操作、セッションでの / 明示選択。再設計されたスキルパネルはメインエージェントとスペシャリストのフィルターを統合し、実際のユーザーのアバタースタックと制限付き「利用者」ポップオーバーを表示し、行操作を集約し、組み込みおよびスペシャリスト連携スキルを保護しながら確認付き一括削除に対応します。
コネクタ ランタイム状態と回復画面を備えた 24 個の組み込み研究コネクタ、編集可能な表示名と分離した不変の小文字呼び出し名を持つローカル/リモート MCP コネクタ、検証可能な上書き付き名前ベースローカル ID、連絡先メタデータ、コネクタ/ツール別権限、認証情報をプレースホルダー化する標準 MCP クライアント設定のインポート/エクスポート。カタログ操作はスキルと同じコンパクトな管理パターンに統一されました。
安全制御 Ask for approvalAuto-approve editsFull access の会話プロファイル、コードプレビューと呼び出し/会話単位の選択を持つ承認ダイアログ、拒否した操作を別経路で再試行または代替実行できないようターン中維持される権限拒否、フィルター・行別/ファミリー別取消・Undo を備えた永続グローバル/プロジェクト/セッション許可、健全性状態とガイド付き回復を備えた GitHub トークン・コネクタキー・コネクタサインインの一元管理、カスタムコネクタが独自のコピーを保存する代わりにバインドできる、デバイス全体で共有する資格情報(API Key、アクセストークン、OAuth サインイン)、欠けている安全なデフォルト許可を再追加する Restore defaults 操作、コネクタ/ツール別ポリシー。
レビューと検証 完了ターンを自身のトランスクリプト・実行ログ・アーティファクトに対して監査し、pass/warn/fail を報告して制限付き修正ループを実行できる任意レビュー、アクティブモデルへの追従または専用プロバイダー・モデル・推論の強度への固定が可能なレビューモデルポリシー、修正帰属を保持する永続レビュー評価スナップショット。
配布とサポート macOS、Windows、Linux のインストーラー、環境・データの場所・エージェントランタイム・モデルプロバイダー・Notebook ランタイムを扱う簡潔な初回設定、ドイツ語・スペイン語・フランス語・簡体字中国語・繁体字中国語・日本語・韓国語・ロシア語のインターフェース、対応する各言語の README、その他の多言語コントリビューションガイド、目立つ更新通知を含む更新ガイド、ローカル診断、コミュニティリンク。

モデルプロバイダー

Open Science は製品レベルでモデルに依存しません。主要クラウド LLM プロバイダーやカスタムゲートウェイに接続するか、既存の Claude または Codex サブスクリプションを再利用できます。現在利用できるプロバイダーは、選択したエージェントバックエンドとその API プロトコルに依存します。モデルへの接続方法は 4 つあります。

プロバイダーモード 動作
組み込みクラウドプロバイダー インストール済みアプリに表示される一覧から選び、指定されたキーで認証します。
カスタムゲートウェイ 互換性のある Base URL、API Key、正確なモデル ID を指定します。デフォルト API 形式(Messages、Chat Completions、Responses)はアクティブなエージェントフレームワークから決まり、新しいゲートウェイをそのまま利用できます。
Codex サブスクリプション Codex エージェントフレームワークを選択し、プロバイダー種別で Codex サブスクリプションを選びます。
Claude サブスクリプション 2 つのモードでログインできます。共有はブラウザーログインの認証情報をデフォルトの ~/.claude プロファイルに保存します。分離はアプリ所有の CLAUDE_CONFIG_DIRclaude setup-token を実行し、~/.claude/ から完全に分離して、ブラウザーフローとトークン貼り付けのフォールバックを提供します。

以前の Local Claude プロバイダーは削除されました。保存済みの Local Claude エントリはアップグレード時に削除されます。Claude Subscription を追加し、共有ブラウザーログインまたは分離された claude setup-token フローで認証してください。

組み込みクラウドベンダーには、OpenAI、Anthropic、Grok (xAI)、DeepSeek、専用 GLM Coding Plan エンドポイントを持つ Zhipu AI (GLM)、Kimi (Moonshot)、MiniMax、専用 Step Plan サブスクリプションエンドポイントを持つ StepFun、Xiaomi MIMO、SenseNova、Volcengine Ark、専用 Bailian for Plan サブスクリプションエンドポイントを持つ Bailian (Alibaba Cloud)、Tencent TokenHub に加えて専用の Tencent Coding Plan と Token Plan サブスクリプションエンドポイント、OpenCode Go、OpenCode Zen、OpenRouter 集約ゲートウェイなどがあります。一部は地域固有です。

プロバイダー、利用可能なモデル、地域別エンドポイントはこの README とは独立して変わる可能性があります。インストール済みアプリのプロバイダー選択と接続テストを正確な情報源としてください。

データ、権限、信頼

Open Science はプロジェクトデータ、設定、アーティファクトバージョン、来歴の根拠をローカルコンピューターに保存します。API Key はローカルに保存され、利用可能な場合は OS の安全な認証情報ストレージで保護されます。ログはローカルにあり、自動アップロードされません。

外部へのデータ送信は発生するため、確認が必要です。

  • モデルリクエストはプロンプトと必要なコンテキストを選択したモデルプロバイダーへ送信します。
  • ウェブ検索とリモートコネクタは表示されたパラメーターを外部サービスへ送信します。
  • ローカルコネクタは信頼されたコマンドをコンピューター上で実行する場合があります。
  • 添付ファイル、@ 参照、ログ、生成レポートには機密研究データが含まれる場合があります。

タスクに適した最小限の権限プロファイルを選択してください。

モード 動作 推奨用途
Ask for approval 編集、コマンド、ネットワーク、コネクタ呼び出しの前に確認 新しいワークフロー、機密データ、未確認のスクリプト
Auto-approve edits ワークスペース編集を自動許可し、コマンド、ネットワーク、コネクタは確認 外部アクセスを制御した信頼できるファイル編集
Full access 編集、コマンド、ネットワーク、コネクタを自動許可 範囲が明確で完全に信頼できる無人作業

承認前にコネクタのパラメーターとツールアクティビティを確認してください。API Key、アクセストークン、患者識別子、未公開データ、機密性の高いローカルパスをスクリーンショットや公開 Issue のログに含めないでください。

プロジェクトの状況

Open Science は macOS、Windows、Linux で利用できる活発に開発中のデスクトップアプリです。信頼できるローカルファースト研究ワークフロー、拡張可能な科学機能、追跡可能な研究アーティファクト、ユーザーが制御できる実行に重点を置いています。

現在のダウンロードとバージョン固有の変更は最新リリースを参照してください。提供済み、一部対応、計画中の機能は機能マップを参照してください。

Open Science は研究の実行と記録を支援しますが、手法、解釈、プライバシー、科学的妥当性の責任は研究者にあります。

開発とパッケージング

Open Science は React、TypeScript、Prisma/SQLite、ACP ベースのエージェントランタイムで構築された Electron アプリです。

ソース開発の前提条件:

  • Node.js 22(.nvmrc を参照)と npm
  • Git
  • Notebook を実行する場合のみ Python 3
git clone https://github.com/aipoch/open-science.git
cd open-science
npm install
npm run dev

npm install は Prisma クライアントを自動生成し、Electron のネイティブ依存関係をインストールします。npm run dev は Electron の main/preload バンドルをビルドし、レンダラーを開始してデスクトップアプリを開きます。開発データは ~/.open-science-project に分離されます。

便利なコマンド:

コマンド 目的
npm run dev 開発アプリを開始
npm run dev:web 開発アプリ + localhost Web UI (127.0.0.1)
npm run dev:headless Electron ウィンドウなしの開発バックエンド + Web UI
npm run lint ESLint を実行
npm run typecheck main と renderer のコードを型チェック
npm test Vitest スイートを実行
npm run build 型チェックしてアプリをビルド
npm run build:web 任意の localhost Web UI をビルド
npm run build:mac macOS ビルドをパッケージ化
npm run build:win Windows ビルドをパッケージ化
npm run build:linux Linux ビルドをパッケージ化

パッケージ出力は dist/ に書き込まれます。

Localhost Web とヘッドレスモード

デスクトップバックエンドは、ローカルコンピューターのブラウザーへ同じレンダラーを任意で提供できます。この機能はデフォルトで無効で、127.0.0.1 だけにバインドします。

npm run build:web
npm run dev:web

アプリが表示する認証済み URL を開きます。npm run dev:headless を使うと、Electron ウィンドウを開かずにバックエンド、トレイ、エージェントランタイム、localhost Web サービスを開始できます。OPEN_SCIENCE_WEB_PORT でポートを選択できます(デフォルト 44100)。アプリを明示的に終了すると、エージェントと Notebook のプロセスも通常どおり終了します。

モバイルリモートアクセス

Remote.It のペアリングにより、スマートフォンやタブレットから同じ localhost Web UI にアクセスできます。6 桁の Open Science コードでブラウザーをペアリングし、デスクトップで一度承認すると、ループバックサーバーを直接公開せずにワークスペースへ接続できます。ブラウザーの信頼は取り消し可能で、モード変更やサービス停止によりアクティブなリモートセッションは直ちに無効になります。

ヘッドレス CLI と SDK

ヘッドレス CLI と依存関係のない Node.js SDK は、デスクトップおよび Web インターフェースと同じローカルデーモン、プロジェクト、セッション、認証情報、権限を使用します。詳細な使用方法は公開可能パッケージと一緒に管理され、コマンドリファレンスを 1 つだけ保守します。

  • CLI ガイド — インストール、サービスライフサイクル、タスク自動化、アーティファクト、出力形式、終了コード
  • SDK パッケージ概要 — Node.js クイックスタートとパッケージエントリーポイント

ロードマップ

製品ロードマップと機能状況は ROADMAP.md で管理します。この README では変化する優先順位やリリース目標の一覧を重複させません。

AIPOCH エコシステムとの関係

オープンな科学 AI ワークフローのデスクトップオーケストレーション層として Open Science が AIPOCH エコシステムに位置する様子

AIPOCHGitHub organization)は、Open Science をオープンな科学 AI ワークフローのデスクトップオーケストレーション層として開発しています。

  • aipoch/medical-research-skills は、500 以上のファイルベース医療・科学研究スキルを収録する大規模なコレクションです。すべてを確認・インポートし、GitHub から Open Science と組み合わせて使用できます。
  • Open Science は、プロジェクト/セッションワークスペース、エージェントランタイム、実行、アーティファクト、プレビュー、権限、コネクタを提供し、それらの指示を対話的なワークフローに変えます。

スキルとコネクタはコードを実行したり、データを外部へ送信したりする場合があります。有効にする前にソース、ライセンス、スクリプト、ネットワーク動作を確認してください。

Open Science ではないもの

Open Science は研究実行と記録管理のツールであり、汎用チャットラッパー、非公式クライアント、科学的レビューの代替ではありません。

  • 単なるチャット UI ではありません。 永続プロジェクト、実行、ファイル、アーティファクト、確認可能なツールアクティビティを中心に構成されています。
  • 他製品の非公式クライアントではありません。 独自のコードベース、データモデル、インターフェース、ロードマップを持つ独立実装です。
  • 科学的判断の代替ではありません。 出力には分野の専門家によるレビュー、統計的検証、一次資料との照合が必要です。

よくある質問

Open Science を初めて開いたときは何をすればよいですか?

回答:EnvironmentData locationAgent runtimeModel providerNotebook runtime の 5 つの設定を完了してください。Action needed と表示された必須項目を解決し、選択したエージェントのインストールまたは修復が提示された場合は実行して、モデル接続をテストします。Notebook の設定とカスタムデータの場所は任意です。

API Key とは何ですか?どこで取得できますか?

回答:API Key はモデルプロバイダーが発行する秘密の認証情報です。プロバイダーの開発者/API コンソールで作成またはコピーします。このキーによるリクエストには料金が発生する場合があります。パスワードと同様に扱い、共有したりリポジトリにコミットしたりしないでください。

API Key は必要ですか?

回答:既存のサブスクリプションログインを再利用する場合は不要です。共有ブラウザーログインまたはアプリ管理の分離された claude setup-token フローによる Claude サブスクリプション、あるいは Codex バックエンドの ChatGPT/Codex サブスクリプションログインを利用できます。組み込みクラウドプロバイダーとカスタムゲートウェイには、それぞれのキーが必要です。

どのモデルプロバイダーを使用できますか?

回答:設定中または Settings → Model でプロバイダー選択を開き、インストール済みアプリと選択したエージェントバックエンドが対応する選択肢を確認してください。組み込みクラウドプロバイダー、互換 Custom Gateway、共有または分離ログインの Claude サブスクリプション、Codex バックエンドの Codex サブスクリプションを利用できます。

モデル接続テストが失敗するのはなぜですか?

回答:API Key に文字抜けや空白がないか、Base URL と地域が正しいか、プロバイダーの正確なモデル ID を使用しているかを確認し、ネットワーク接続とアカウント残高も確認してください。Claude サブスクリプションでは、選択モードに応じて共有ブラウザーログインを再試行するか、分離された claude setup-token 認証情報を更新してください。

設定中に Continue が無効なのはなぜですか?

回答:現在の手順の必須条件を満たしていません。手順に応じて、Action needed の環境項目を解決する、選択したエージェントランタイムをインストールまたは修復する、モデルプロバイダーを検証する、のいずれかを行ってください。Notebook 設定は任意で、Notebook の実行だけに影響します。

設定が完了しました。研究タスクを始めるにはどうすればよいですか?

回答:プロジェクトを作成または開き、セッションを開始して、ソースファイルを添付し、目標、制約、必要な出力、検証基準を説明します。@ でプロジェクトファイルを参照し、/ で有効なスキルを選択します。

リモート HPC クラスターでジョブを実行するにはどうすればよいですか?

回答:Settings → SkillsRemote Compute (SSH) スキルを有効にし、Settings → Compute でクラスターを登録します。セッションを開始して /remote-compute-ssh でスキルを選択してください。ホスト登録、SSH による短いコマンド、完全非同期のジョブ送信をスキルが処理します。ジョブ完了時にアプリが分析ターンを自動開始するため、ポーリングループは不要です。

コマンドラインインターフェースはありますか?

回答:あります。Settings → General → Command line tool → Install command からワンクリックでインストールできます(open-science を PATH に追加し、別途 Node.js は不要です)。CLI はブラウザーを開かずにローカルサービスを制御し、研究タスクを送信します。

# サービスをバックグラウンドで開始
open-science start --no-open

# プロジェクトを作成し、正確な名前でタスクを実行
open-science project create "Systematic review"
open-science run --project "Systematic review" \
  --prompt-file ./task.md \
  --approval-profile auto \
  --skill literature-review \
  --wait --json

# 生成されたアーティファクトをダウンロード
open-science artifacts list <session-id> --json
open-science artifacts download <artifact-id> --output ./report.md

完全なコマンドリファレンス、JSON/JSONL 出力形式、終了コード、ヘッドレスサービスの選択肢は CLI ガイドを参照してください。

生成結果の出所を確認するにはどうすればよいですか?

回答:生成されたアーティファクトを開き、Provenance を選択します。バージョンを選択し、コンテンツ ID と、利用できる生成コード、実行履歴、入力、環境インベントリ、生成元の会話コンテキスト、レビュー根拠を確認します。Open Science が検証できなかった根拠は利用不可と表示されます。

後続の会話を失わずに以前のリクエストを変更できますか?

回答:できます。完了したユーザーメッセージを編集して再送信すると、その位置から新しいブランチが作成されます。元の後続ターンは残り、メッセージ横のリビジョン矢印で別の経路に切り替えられます。

研究データは自分のコンピューターに残りますか?

回答:プロジェクト、セッション、ファイル、設定、構成済み認証情報はデフォルトでローカルに保存されます。モデルリクエスト、ウェブ検索、コネクタ呼び出しに必要な内容は、選択した外部サービスへ送信される場合があります。タスク実行前に機密入力とプロバイダーのポリシーを確認してください。

参加する

Open Science では、バグ報告、機能提案、設計に関する議論、コミュニティからの質問、コントリビューションを GitHub、Discord、X、AIPOCH ウェブサイトで受け付けています。目的に合うチャンネルを選び、プロジェクトの詳細を公開する前に、リンク先のコントリビューションガイドと公開投稿に関する安全上の注意を確認してください。

チャンネル 用途
GitHub Issues バグ、再現可能な障害、具体的な機能提案
GitHub Discussions 設計上の質問、ロードマップ提案、長めの技術的な議論
Discord コミュニティサポート、コントリビューターの調整、気軽な議論
X / @aipoch_ai リリース発表と公開開発の更新
Open Science 公式サイト 公式の製品概要とダウンロード

公開 Issue を作成する前に、ログとスクリーンショットから API Key、トークン、非公開ファイルパス、未公開データ、患者識別子、その他の機密情報を削除してください。開発ワークフローはコントリビューションガイドを参照してください。

リポジトリに Star: このプロジェクトが役立った場合は、GitHub で Star を付けていただけると助かります。Star は継続的な開発を後押しします。数秒ででき、プロジェクトに大きな意味があります。

ライセンス

Apache License 2.0 — LICENSE を参照してください。