You signed in with another tab or window. Reload to refresh your session.You signed out in another tab or window. Reload to refresh your session.You switched accounts on another tab or window. Reload to refresh your session.Dismiss alert
OlgaBond edited this page Oct 7, 2014
·
1 revision
Задачи минимум:
1. Составить сводную таблицу по работе всех тулов с проверкой, насколько точны те координаты, которые они дают (включая интроны)
2. Поиск гомологов в геноме, используя как референс ___N. tetrosperma___
3. Гомологи, в которых мы точно уверены, отобрать в отдельный файл.
4. Написать программу, которая в последовательности гена Start(ATG), stop(TGA, TAG, TAA) и сайты сплайсинга(GTCC, (T/G)TCCATCA).
5. Проверить качество программы на тех гомологах, которые мы отобрали (п.3)
Задача максимум:
6. Разобраться в работе программ, котрые нам дали: как их запускать, что давать на вход, что выдают на выходе (Augustus, The Korf Lab SNAP)
7. Запустить программу на наш геном и найти все открытые рамки считывания.