Este repositório contém scripts e informações sobre o processo de montagem do genoma mitocondrial usando as ferramentas NOVOPlasty e Unicycler, além de análises adicionais relacionadas.
O NOVOPlasty é uma ferramenta de montagem de genomas mitocondriais de baixa cobertura. Ele pode ser usado para montar genomas mitocondriais usando dados de sequenciamento de DNA genômico de alta profundidade. Neste repositório, você encontrará o script utilizado para montar o genom mitocondrial com o NOVOPlasty.
O Unicycler é uma ferramenta de montagem de genomas híbridos que pode ser usada para montar genomas bacterianos, incluindo genomas mitocondriais. Ele utiliza uma abordagem de montagem híbrida que combina dados de sequenciamento de curto e longo alcance para produzir montagens mais precisas. Aqui, você encontrará os scripts sobre como usar o Unicycler para montar genomas mitocondriais a partir do mtDNA gerado pelo NOVOPlasty.