Reprohackathon 2024

L'objectif de ce projet est de reproduire les analyses réalisées dans la publication suivante en utilisant les technologies de conteneurisation Singularity et de gestion de pipeline Snakemake.

Peyrusson, F., Varet, H., Nguyen, T.K. et al. Intracellular Staphylococcus aureus persisters upon antibiotic exposure. Nat Commun 11, 2200 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-15966-7

Installation

Prérequis :

• singularity >= 3.0.1
• snakemake

Cloner le dépôt

git clone https://github.com/lauronta/reprohack.git

Lancer le workflow

cd reprohack/
./run.sh