MultiPockGA

Proyecto base para experimentos con algoritmos geneticos.

Estructura

• multipockga/: paquete principal
• config/: configuraciones
• datasets/: datos de entrada
• scripts/: scripts utilitarios y ejecucion
• experiments/: notebooks/resultados/pruebas experimentales
• tests/: tests automatizados

Inicio rapido

Conda

conda env create -f environment.yml
conda activate multipockga

Pip

pip install -e .

Tests

pytest -q

Seleccion De Docking

El GA usa siempre operadores de AutoGrow para crossover y mutation.

• Para docking con Vina/MGLTools usa config/docking.yaml.

La configuracion genera intermedios por receptor en experiments/.../tmp/<receptor>/docking_results_<epoch>_temp.csv y un archivo combinado por epoch en experiments/.../rewards/reward_results_<epoch>.csv.

Ejecucion:

python scripts/run_ga.py -c config/docking.yaml