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Olá, eu sou a Érica Souza! 👋

Bioinformata | PhD em Genética & Evolução | Especialista em Genômica

Sou uma pesquisadora apaixonada por transformar dados biológicos complexos em conhecimento acionável através de código. Com sólida formação acadêmica (Doutorado na UNICAMP e Pós-Doc na UAST-UFRPE), estou focada no desenvolvimento de pipelines de bioinformática, análises de NGS (Next-Generation Sequencing) e automação em ambientes de Alto Desempenho (HPC).

Atualmente, combino minha experiência em biologia evolutiva com ferramentas modernas de engenharia de software para resolver problemas em transcriptômica e genômica de populações.


🛠️ Tecnologias & Ferramentas

Linguagens: Python R Bash Script

Bioinformática & Dados: Bioinformatics Data Science Linux

Infraestrutura & Versionamento: Docker Git AWS


🧬 O que estou desenvolvendo agora

  • 🔭 Análise Transcriptômica em HPC: Otimização de pipelines para processamento de RNA-Seq de peixes amazônicos (Colossoma macropomum), focando em genes de resposta à hipóxia.
  • 🧪 Pipelines Reprodutíveis: Implementação de workflows automatizados para garantir integridade e rastreabilidade de dados genômicos.
  • 📚 Ensino: Desenvolvimento de material didático e scripts para ensino de Morfometria Geométrica e ferramentas de bioinformática para pós-graduação.

📂 Projetos em Destaque

Abaixo estão exemplos do meu trabalho com análise de dados e scripting:

  • Manatee Genomics Analysis (Renomear seu repo 'scripts' para este nome)

    • Stack: R, Bash.
    • Descrição: Scripts utilizados para análise populacional e filogeográfica de peixes-boi (Trichechus), incluindo plotagem de mapas de distribuição e estatística multivariada.
  • Ensino & Capacitação (Link para o futuro repo de ensino)

    • Stack: Python, Estatística.
    • Descrição: Recursos e roteiros práticos desenvolvidos para capacitação de alunos de pós-graduação em ferramentas de análise biológica.

📝 Escrita Técnica & Blog

Além de codificar, gosto de documentar processos e ensinar conceitos de biologia molecular e dados.

  • Data Science & Biologia - Blog pessoal onde discuto metodologias (ex: Desenho de Primers).
  • (Em breve) Desafios na digitalização 3D de espécimes biológicos.

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