Im Datensatz "COVID-19-Hospitalisierungen in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden täglich aktualisierte Informationen zu Hospitalisierungen im Zusammenhang mit COVID-19 basierend auf den Meldungen nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Neben tagesaktuellen Fallzahlen und Inzidenzen auf Bundes- und Länderebene enthält der...

Im Datensatz "SARS-CoV-2-Sequenzdaten aus Deutschland" umfasst vollständige Virusgenomsequenzen sowie zugehörige Metadaten aus bundesweit erhobenen Proben. Die Proben werden in Zusammenarbeit vom IMSSC2-Labornetzwerk, dem Nationalen Referenzzentrum für Coronaviren an der Charité sowie dem RKI sequenziert und bioinformatisch analysiert. Der Daten...

Im Datensatz "SARS-CoV-2 Infektionen in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden die Daten basierend auf Meldungen zu SARS-CoV-2 Infektionen nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Darin enthalten sind Informationen auf Landkreisebene zu bestätigten Infektionen, Todesfällen und Genesungen, differenziert nach Altersgruppen und...

Im Datensatz "Abwassersurveillance AMELAG" des Robert Koch-Instituts und Umweltbundesamts werden Daten aus der Überwachung von Infektionserregern im Abwasser bereitgestellt. Die Daten zur SARS-CoV-2-Viruslast werden seit Februar 2022 in einem bundesweiten Netzwerk von Kläranlagen, Laboren und Behörden erhoben. Seitdem wurden die Daten um die Vir...

Im Datensatz "GrippeWeb - Daten des Wochenberichts" des Robert Koch-Instituts werden wöchentliche, bevölkerungsbasierte Schätzungen zur Inzidenz akuter respiratorischer Erkrankungen (ARE) und grippeähnlicher Erkrankungen (ILI) in Deutschland bereitgestellt. GrippeWeb als Online-Portal zur partizipativen syndromischen Surveillance nutzt Selbstaus...

Der Datensatz "Intensivkapazitäten und COVID-19-Intensivbettenbelegung in Deutschland" des Robert Koch-Instituts dokumentiert die tägliche intensivmedizinische Versorgungslage seit der COVID-19-Pandemie. Basierend auf Meldungen aller intensivbettenführenden Krankenhäuser in Deutschland erfasst das DIVI-Intensivregister Echtzeitdaten zu belegten ...

Im Datensatz "7-Tage-Inzidenz der COVID-19-Fälle in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden die täglich aktualisierten COVID-19-Inzidenzen auf Bundes-, Landes- und Landkreisebene basierend auf den Meldungen nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Die 7-Tage-Inzidenz wird definiert als Anzahl gemeldeter Fälle der letzten sieb...

Im Datensatz "COVID-19-Todesfälle in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden täglich aktualisierte Informationen zu COVID-19-bedingten Todesfällen in Deutschland bereitgestellt. Die Datenerhebung erfolgt im Rahmen des Infektionsschutzgesetzes (IfSG). Der Datensatz umfasst aggregierte Todesfallzahlen nach Berichtsdatum, Altersgruppen und Bu...

Im Datensatz "Gesundheitsberichterstattung - Daten zu nichtübertragbaren Erkrankungen" des Robert Koch-Instituts (RKI) werden regelmäßig umfassende Daten zur gesundheitlichen Lage der Bevölkerung in Deutschland bereitgestellt, mit einem besonderen Fokus auf nichtübertragbare Erkrankungen (NCD) wie Diabetes mellitus, Herz-Kreislauf-Erkrankungen, ...

Im Datensatz "Laborbestätigte Influenzafälle in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden die Daten basierend auf Meldungen zu Infektionen mit dem Influenzavirus nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Darin enthalten sind Informationen auf Bundeslandebene zu Infektionen nach Falldefinition des Robert Koch-Instituts, differenz...

This repository contains the code for the manuscript Ensemble-labeling of infectious diseases time series to evaluate early warning systems with which you can reproduce the manuscript's results and figures.

The dataset "Supplementary raw data on cell chaining in an attenuated Listeria monocytogenes mutant" provides the raw images and data for the manuscript "On the role of cell chaining in the attenuation of a Listeria monocytogenes divIVA mutant" (https://doi.org/10.64898/2026.01.05.697648).

Im Datensatz "AKTIN – Daten zur Aufenthaltsdauer in Notaufnahmen" werden aggregierte Daten der Routinedokumentation aus einer Auswahl deutscher Notaufnahmen aus dem AKTIN-Notaufnahmeregister bereitgestellt. Anhand der Aufenthaltsdauer kann die Belastungssituation von Notaufnahmen abgeschätzt werden. Dies ermöglicht eine kontinuierliche und tran...

Im Datensatz "Respiratorische Synzytialvirusfälle in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden die Daten basierend auf Meldungen zu Infektionen mit dem Respiratorischen Synzytial-Virus (RSV) nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Darin enthalten sind Informationen auf Bundeslandebene zu Infektionen nach Falldefinition des Rob...

Im interaktiven Bericht "Abwassersurveillance AMELAG - Wochenbericht" des Robert Koch-Instituts und Umweltbundesamts werden die Daten aus der Überwachung von Infektionserregern im Abwasser dargestellt. Die Daten zur SARS-CoV-2-Viruslast werden seit Februar 2022 in einem bundesweiten Netzwerk von Kläranlagen, Laboren und Behörden erhoben. Seitdem...

Der Wochenbericht des RKI zur Übersterblichkeit gibt einen Überblick über die aktuelle Entwicklung der Sterblichkeit in Deutschland. Zur Bestimmung der Übersterblichkeit werden die gegenwärtigen Sterbefallzahlen mit einem erwarteten Referenzwert verglichen, der aus den Sterbedaten der vergangenen Jahre abgeleitet wird. Übersteigt die aktuelle Za...

Im Datensatz "Daten des Übersterblichkeitsberichts" des Robert Koch-Instituts werden wöchentliche Daten zur Übersterblichkeit in Deutschland bereitgestellt. Der Datensatz enthält Angaben zum Wochendatum und zur jeweiligen Gruppe (z. B. Altersgruppen, Geschlecht oder Region). Für jede Gruppe wird die beobachtete Sterbefallzahl den modellbasiert e...

Implementation of a dynamic transmission model for modelling meningococcal transmission in Germany at the carrier level, as well as estimating the effects of different vaccination strategies. The software makes it possible to reproduce the results of the manuscript "The impact of introducing meningococcal C/ACWY booster vaccination among adolesc...