Statement

English

Version V2.1.86 has provided end users with an integrated module download link:
https://github.com/yudalang3/eGPS_v2.1

This repository no longer provides downloadable versions.

Users are now requested to download from the new repository.

If users only want the modules for the Pathway Evolution Browser, they can simply delete the .jar files they do not need.

中文

版本V2.1.86已经为终端用户提供一个集成模块下载地址：https://github.com/yudalang3/eGPS_v2.1

现在本仓库不再提供下载版本，用户可以去新的仓库下载。

如果用户只想要通路进化浏览器的模块，可以直接移除你不需要的jar文件即可。

Note:

• Additionally, modules and plugins are the same thing. You can simply place this .jar file into the ~/.egps/plugin directory, and it will automatically become a plugin.

• You can also use the iTools Manager module to configure and selectively load only the modules you need.

• 另外，模块和插件是一样的，你完全可以把这个jar放到 ~/.egps/plugin目录中，它就成为了一个插件

• 你也可以通过 iTools manager 模块进行配置，只加载你需要的模块。

V2.1.75

2.1.74 Alignment View，修复一个小细节：当Font改变后，id和右边的序列没对齐。 2026/1/9
2.1.75 PEB（通路进化浏览器）支持Excel 导入。 2026/1/9

新增另外两个操作系统的绿色，免安装版本。

2.1.74 Alignment View: Fixed a minor detail where the IDs and the sequences on the right were not aligned after changing the font. January 9, 2026
2.1.75 PEB (Pathway Evolution Browser): Added support for Excel import. January 9, 2026

Added portable, no-installation versions for two additional operating systems.

V2.1.73

2.1.70 《现代化进化树》读取格式精准报错以及添加完整的格式说明文档。 2026/1/8
2.1.71 进化树导出最后添加;同时添加《modernization of evolutionary tree》的格式说明文档，代码新增更多的格式错误提示。 2026/1/8
2.1.71 增强 VOICE-GUI 界面的很多功能，一些布局的局部调整，使新用户容易上手。 2026/1/9
2.1.72 通路进化浏览器新增进化树和分析面板的双向交互功能。 2026/1/9
2.1.73 Alignment View，在导出 PDF 时可以指定每行显示的碱基数量，而不是固定按 A4 页面宽度自动计算，用户可以自己设置宽度。 2026/1/9

V2.1.69

修复 《现代化进化树》点了这个按钮之后，进化树的可视化模块没反应。

V2.1.0.43

修复AlignmentView 导出的问题

布局选项更新：

格式	Continuous	Interleaved	Current View
FASTA	✅ 不换行	✅ 100bp换行	❌
其他序列	❌	❌	❌
JPG/PNG	✅ 完整	❌	✅ 当前
SVG/EPS	✅ 完整	❌	✅ 当前
PDF	✅ 单页	✅ 多页分块	✅ 当前
PPTX	❌	❌	✅ 强制

又新增“是否导出共识区域功能”

格式	Continuous	Interleaved	Current View
PNG/JPG	✅ 支持	-	❌ 不支持*
SVG/EPS	✅ 支持	-	❌ 不支持*
PDF	✅ 支持	✅ 支持	❌ 不支持*
PPTX	-	-	❌ 不支持*

Current View 模式直接截取屏幕上显示的内容，无法通过选项隐藏 Consensus 区域。如果需要导出不含 Consensus 的 Current View，建议使用 Continuous 布局导出。

Current View不支持，用户可以使用PDF去掉共识区域

V2.1.0.42

Release an all-in-one package containing everything needed to run the software.

发布直接可用的所有环境打包在一起的版本。

V0.0.1

See the start_debug_noJRE.bat for how to launch.
In Windows OS, just double click to launch.

No JRE bound, please see readme for how to run.

Why no JRE?
Because for the fast iteration.