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chengzhimin/biogen

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BioGen AI - AI驱动的医疗研究平台

BioGen AI License Version

项目简介

BioGen AI 是一个基于人工智能的医疗研究平台,专注于提供以下核心功能:

  • 🧬 抗体从头生成工具 - 利用深度学习从头设计高亲和力抗体序列
  • 🔬 Binder从头生成工具 - 基于物理原理和深度学习设计特异性蛋白质Binder
  • 🧠 AI医疗问答系统 - 智能医疗知识问答和研究助手

功能特色

抗体重头生成

  • 支持FASTA格式抗原序列输入
  • 多种抗体类型选择(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE)
  • CDR区域优化和亲和力预测
  • 实时3D结构预览
  • 批量生成和导出功能

Binder从头生成

  • PDB ID或序列输入支持
  • 交互式3D结合位点选择
  • 结合能和特异性评估
  • 分子相互作用分析
  • 实验验证指导

AI医疗问答

  • 自然语言理解和处理
  • 医学文献智能检索
  • 多模态医学影像分析
  • 实时语音输入和播报
  • 相关论文推荐

技术栈

前端技术

  • HTML5 - 语义化标记
  • CSS3 - Tailwind CSS框架
  • JavaScript - ES6+

动画和可视化库

  • Anime.js - 流畅的UI动画
  • Matter.js - 物理引擎动画
  • p5.js - 创意编程和粒子效果
  • ECharts - 数据可视化图表

设计系统

  • 主色调 - 深海蓝 (#1a365d)
  • 辅助色 - 薄荷绿 (#38b2ac)
  • 强调色 - 琥珀橙 (#ed8936)
  • 字体 - Inter (Google Fonts)

快速开始

在线访问

直接访问 GitHub Pages 部署的网站:

https://chengzhimin.github.io/biogen/

🚀 立即访问 BioGen AI 平台

本地开发

  1. 克隆仓库
git clone https://github.com/chengzhimin/biogen.git
cd biogen
  1. 启动本地服务器
# 使用 Python
python -m http.server 8000

# 或使用 Node.js
npx http-server -p 8000
  1. 访问应用 打开浏览器访问 http://localhost:8000

项目结构

biogen-ai/
├── index.html          # 主页
├── antibody.html       # 抗体生成工具页面
├── binder.html         # Binder设计工具页面
├── biomni.html         # AI问答系统页面
├── main.js             # 主JavaScript文件
├── resources/          # 图片资源目录
│   ├── hero-lab.png
│   ├── antibody-binding.png
│   ├── binder-design.png
│   └── ai-medical-brain.png
└── README.md           # 项目文档

使用指南

抗体生成工具

  1. 在输入框中输入目标抗原序列(FASTA格式)
  2. 选择抗体类型(IgG、IgM等)
  3. 调整设计参数(亲和力、稳定性、生成数量)
  4. 点击"开始生成抗体"按钮
  5. 查看生成结果,包括序列、亲和力预测和CDR区域

Binder设计工具

  1. 输入靶标蛋白的PDB ID或序列
  2. 选择目标类型(蛋白质、肽段、受体、酶)
  3. 加载靶标结构
  4. 在3D视图中选择结合位点
  5. 设置Binder长度、亲和力和稳定性参数
  6. 生成Binder并查看结合分析

AI医疗问答

  1. 选择快速查询类别或直接输入问题
  2. 支持文本输入或语音输入
  3. 查看AI回答和相关文献引用
  4. 浏览推荐的学术论文
  5. 查看相关知识图谱

浏览器支持

  • Chrome (推荐)
  • Firefox
  • Safari
  • Edge

建议使用最新版本的现代浏览器以获得最佳体验。

贡献指南

欢迎贡献代码!请遵循以下步骤:

  1. Fork 本仓库
  2. 创建特性分支 (git checkout -b feature/AmazingFeature)
  3. 提交更改 (git commit -m 'Add some AmazingFeature')
  4. 推送到分支 (git push origin feature/AmazingFeature)
  5. 开启 Pull Request

开发路线图

  • 核心功能实现
  • UI/UX设计优化
  • 响应式布局
  • 后端API集成
  • 用户认证系统
  • 数据持久化
  • 高级数据可视化
  • 移动端应用

常见问题

Q: 这个平台是否需要安装任何软件? A: 不需要。BioGen AI是一个纯前端Web应用,只需要浏览器即可访问。

Q: 生成的抗体序列是否经过实验验证? A: 当前版本显示的是模拟数据。实际应用中需要结合实验验证。

Q: 是否支持导出结果? A: 是的,所有生成的序列和分析结果都可以导出为多种格式。

Q: 平台是否收费? A: 当前版本是开源免费的演示版本。

许可证

本项目采用 MIT 许可证。详见 LICENSE 文件。

致谢

感谢以下开源项目和资源:


© 2025 BioGen AI. 致力于推动AI驱动的医疗研究创新.

About

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License

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